2006年日本京都大學山中伸彌領導的實驗室在世界著名學術雜志《細胞》上率先報道了誘導多能干細胞（Induced Pluripotent Stem
cells，iPS）的研究。他們把Oct3/4、Sox2、c-Myc和Klf4這4種轉錄因子引入小鼠胚胎或皮膚纖維母細胞，發現可誘導其發生轉化，產生的iPS細胞在形態、基因和蛋白表達、表觀遺傳修飾狀態、細胞倍增能力、類胚體和畸形瘤生成能力、分化能力等都與胚胎干細胞極為相似。隨后，他們進一步通過改進篩選技術得到了更接近于胚胎干細胞的多能干細胞，把這些細胞注入小鼠囊胚中再植入體內后可孕育出活的遺傳混雜型（Chimera）仔鼠，甚至產出完全由iPS細胞發育而成的仔鼠。
很快，美國的幾家實驗室也陸續發表了相似的研究結果。2007年末，Thompson實驗室和山中伸彌實驗室幾乎同時報道，利用iPS技術同樣可以誘導人皮膚纖維母細胞成為幾乎與胚胎干細胞完全一樣的多能干細胞，所不同的是日本實驗室依然采用了用逆轉錄病毒引入以上4種因子組合，而Thompson
實驗室則采用了以慢病毒載體引入OCT4、SOX2加NANOG和LIN28這種因子組合。這些研究成果在科學界和大眾媒體中都引起了很大轟動，也因此被美國《科學》雜志列為2007年十大科技突破中的第2位。
2008年，iPS的研究熱潮持續高漲，并取得了多項令人矚目的進展。哈佛大學George
Daley實驗室利用誘導細胞重新編程技術把采自10種不同遺傳病患者病人的皮膚細胞轉變為iPS，這些細胞將會在建立疾病模型、藥物篩選等方面發揮重要作用。美國科學家還發現，iPS可在適當誘導條件下定向分化，如變成血細胞，再用于治療疾病。哈佛大學另一家實驗室則發現利用病毒將3種在細胞發育過程中起重要作用的轉錄因子引入小鼠胰腺外分泌細胞，可以直接使其轉變成與干細胞極為相似的細胞，并且可以分泌胰島素、有效降低血糖。這表明利用誘導重新編程技術可以直接獲得某一特定組織細胞，而不必先經過誘導多能干細胞這一步。
iPS技術無疑是最近兩年干細胞研究所取得的最為突出的成果，因此入選《科學》雜志年度十大科技突破，并名列榜首。與經典的胚胎干細胞技術和體細胞核移植技術不同，iPS技術不使用胚胎細胞或卵細胞，因此沒有倫理學的問題。
利用iPS技術可以用病人自己的體細胞制備專用的干細胞，所以不會有免疫排斥的問題。然而，iPS的研究還只是剛剛起步，有許多技術難題還有待解決。例如，現在的iPS技術主要采用病毒載體引入細胞因子，這些病毒隨機插進基因組后存在著激活致癌基因或抑制抑癌基因的可能性，許多方法中還使用了c-
Myc原癌基因，因此存在較大的致瘤風險，顯然不可能應用于臨床。當前和今后一段時間的研究將繼續優化方法，如使用質粒載體、融合蛋白、小分子等替代病毒載體。
另外，目前對iPS特性的認識也很膚淺，究竟它與未經任何遺傳修飾的胚胎干細胞有多少異同還需要通過大量深入細致的研究才能搞清楚。可以預見，在今后相當長的一段時間內，胚胎干細胞技術、體細胞核移植技術和iPS技術還不太可能進入臨床應用階段，需要繼續研究和共同發展。