質粒DNA的轉化和染色體DNA的轉化有顯著的不同。
在一般情況下前者的轉化效率遠遠低于后者。
但如果先用一定濃度的鈣離子處理大腸桿菌細胞，再用質粒DNA和染色體DNA對它做轉化實驗則情況恰好相反。此外，質粒DNA很容易進入去掉了細胞壁的細菌的原生質體，說明對它的吸收并不通過專門的接受位點；
質粒DNA的轉化過程沒有整合這一環節。
