質譜分析法，指的是將樣品分子經過離子化后，利用其不同質荷比（m/z）的離子在靜電場或磁場中受到的作用力不同而改變運動方向，使其彼此在空間上分離，最后通過收集和檢測這些離子得到質譜圖譜，實現分析目的一種分析方法。
質譜圖，橫軸表示單位電荷質量（m/z）；縱軸表示離子流強度，通常以相對強度（相對豐度）來表示。相對豐度以最強的離子流強度定義為100%，其他離子流以其百分比顯示。質譜圖的解析需要很強的專業讀圖能力，各大質譜生產企業也會提供相應的質譜數據庫及解析服務。
質譜儀（Mass Spectrometry）一般由進樣系統（Inlet System）、離子源（Ion Source）、質量分析器（Mass Analyzer）、檢測器（Ion Detector）等四部分構成。其中，離子源與質量分析器是質譜儀的技術核心。不同離子源與質量分析器比較詳見附錄。
技術壁壘較高，短期生產端仍以進口品牌為主
國外核心技術的ZL申請在1980s后經歷較大的爆發期。1912年J.J.Thomson研制第一臺質譜儀用于辨別氖元素及其同位素，100多年內質譜的技術高度與運用領域得到不斷提升。早年質譜儀主要用于同位素測定和無機物分析，1940s后開始用于有機物分析；1960s首次出現氣相色譜和質譜的聯用（GC-MS），質譜成為有機物分析的重要方法。1980s后隨著計算機的加入，各類技術的升級，全球質譜得到了極快的發展，并在更廣發領域應用。
目前國產質譜與進口品牌仍存較大差距，特別是國際主流質譜生產企業離子源與質量分析器的核心ZL，短期仍是制約國產質譜設備發展的關鍵因素。從全球主流質譜生產企業來看，沃特世、安捷倫、賽默飛世爾、布魯克等在中國區均有ZL保護。
生產端國產化水平較低，短期仍以進口品牌為主。相較于海外100多年的發展歷史，我國質譜技術發展起步較晚，人才儲備相對匱乏，直到2000年后才逐步開始質譜技術的積累。2006年北京東西分析儀器有限公司推出四級桿氣質聯用儀GCMS-3100是國內第一臺商業化質譜產品。
目前國產質譜儀占有率相對較低，2016年抽樣調查中LC-MS及GC-MS國產化率均不到2%。我們預計在核心ZL到期或國產器械有較大技術突破前，國內質譜市場仍將以進口品牌為主。短期就醫藥臨床檢測市場而言，用于微生物檢測的MALDI-TOF MS國內近兩年有比較快的發展。
國內近兩年MALDI-TOF質譜的生產在一定程度上有所突破，包括最早上市的毅新博創的clinTOF I以及近一兩年的融智生物、安圖生物、禾信儀器、東西分析等都陸續有產品申報或上市，我們認為類似于化學發光子領域的進口替代，國產質譜進口替代的順利與否仍需市場檢驗。
臨床檢測，質譜服務端的125億藍海市場
質譜臨床檢測，IVD百億市場新興領域
全球質譜儀市場發展相對穩定，2016年預計設備市場53億美金，至2021年預計復合增長率約在7.9%，屆時將有望達到77億美元市場規模。國內質譜設備市場尚處于發展初期，98%左右質譜仍為進口品牌，以海關數據估算2016年中國質譜儀市場約在4.5億美元左右。
生物醫藥是質譜應用的第三大應用領域，約占6%，其他則主要用于環境、半導體等傳統領域的檢測。生物醫藥，特別是臨床方面的檢測，在國內仍處于應用開發的初期。生物醫藥常用的質譜儀類型主要有LC-MS/MS、GCMS、QTOF-MS/Orbitrap、MALDI-TOF，其中LC-MS/MS是臨床檢測的主要應用機型。2008年Waters在國內上市的串聯質譜新生兒篩查系統是CFDA批復的最早在臨床應用的質譜儀，此后幾年包括布魯克、梅里埃、美國AB SCIEX等均在國內質譜臨床應用方面開始布局。國內毅新博創、塞爾迪、意誠默迪等也在注冊方面有一定突破，但截至目前國內臨床質譜仍然基本以進口品牌為主。
相比傳統的免疫檢測，質譜檢測在檢測的靈敏度、特異性、分析速度、多指標同時檢測等方面有非常強的優勢，在新生兒遺傳代謝病篩查、維生素及激素、治療藥物檢測、微生物鑒定等領域均有較大的發展潛力，我們預計質譜檢測市場初期將會是一個百億以上的新興市場，市場空間的進一步打開則需要類似美國LDT制度的支持。
主要應用領域一：新生兒遺傳代謝病篩查——22億元市場空間
遺傳代謝病是因維持機體正常代謝所必需的某些由多肽和（或）蛋白組成的酶、受體、載體及膜泵生物合成發生遺傳缺陷，即編碼這類多肽（蛋白）的基因發生突變而導致的疾病。新生兒遺傳代謝病篩查旨在早診斷早治療，避免癡呆兒、缺陷兒等不幸發生。
美國醫學遺傳學會（ACMG）將54種遺傳疾病納入新生兒篩查項目。其中29種首要疾病和25種次要疾病，廣泛使用LC-MS/MS進行篩查。
國內遺傳代謝病享受補助的包括新生兒苯丙酮尿癥（PKU）、先天性甲狀腺功能減低癥（CH），南方部分地區涉及先天性腎上腺皮質增生癥（CAH）和葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺乏癥（G-6-PD）等。其他40余項檢查均為自費項目，可根據家族遺傳病歷史選擇檢查。
質譜的一血多檢優勢明顯，檢測項目越多綜合成本越低。傳統新生兒遺傳代謝病篩查多采用免疫方法學檢測，一次僅可檢測一種疾病項目，目前各地多采用的模式是在政府補貼項目基礎上再根據家族遺傳病史自選加項。目前國內遺傳病篩查涉及40多項，考慮到決策的父母對家族病史并不甚了解的情況，如需做40多次檢測，綜合費用將高至500-1500元/人次。
質譜檢測無需按疾病單病種檢測，僅需一個樣本即可完成對多個檢測項目的篩查。目前各地市場仍處發展初期，檢測項目有所差別，費用在200-500元/人次區間。短期相對于3-4項疾病的簡單傳統篩查，費用仍相對較高。但未來隨著新生兒篩查檢測項目的增多，操作和成本優勢將越來越明顯。
新生兒代謝遺傳病質譜檢測，22億市場空間。2003-2013年期間國內年新生兒人數在1600萬人附近波動，2016年國內新生兒人數1846萬人，考慮二孩放開的沖擊的持續影響，我們預計未來年新生兒人數在1800萬人以上。2007年全國新生兒平均篩查率39%，2010年超過50%，我們預計2016年篩查率達到近70%。在質譜檢測40%滲透率，300元/人均費用假設前提下，市場空間約22億元，我們預計未來隨著質譜檢測滲透率的提升，潛在空間廣闊。
主要應用領域二：維生素D檢測——76億元以上市場空間
維生素D是重要健康指標，國內檢測尚未普及。維生素D是類固醇衍生物，又可細分為維生素D2和維生素D3，在人體內通過促進腸道內鈣磷吸收、提高腎小管對鈣磷吸收增加血鈣濃度，并在血鈣過低時，配合甲狀旁腺素（parathyroid hormone，PTH）促進鈣磷從骨骼中釋放。
長期維生素D缺乏會導致佝僂病、骨質疏松、骨軟化等疾病，近年研究也表明維生素D缺乏與腫瘤、高血壓、糖尿病等并發癥有一定聯系。定期檢測維生素D水平對疾病預防有重要意義，部分歐美國家已將維生素D納入常規體檢。
質譜法是維生素D檢測的金標準。體內維生素D2和維生素D3經血液循環轉運至肝臟，在肝酶作用想轉化為25-羥基維生素D（25（OH）D），再轉運到腎臟，第二次羥化成1,25（OH）2D。人體內維生素D2含量相對較低，傳統方法如放射免疫、競爭蛋白結合法、化學發光發等通過檢測血清25（OH）D總量測試體內維生素D總量，特異性及抗基質干擾能力差，無法做到同時檢測25（OH）D2和25（OH）D3，因此無法準確反映維生素D情況，這也是國內維生素D檢測未廣泛開展的主因之一。串聯質譜法是目前全球公認檢測維生素D的金標準。