1. 連接電源，按下UV按鈕，進行紫外消毒30分鐘。
2. 按下UV按鈕，關閉紫外燈，按下風機按鈕，工作臺進入自凈化狀態，操作面板上顯示自凈化，當自凈化時間到時再抬起工作臺前面的擋風板（不宜過高，手伸進去可以操作即可）。
3. 用酒精對超凈工作臺表面擦拭，待一分鐘后可進行操作。
4. 在工作臺中減少手部的大幅度移動，避免擾動氣流。
5. 操作結束后，用0.1%的新吉爾滅溶液擦拭超凈工作臺內的器具及臺面，再用酒精擦拭一遍，按下擋風板，關掉風機。
6. 按下UV按鈕，進行紫外消毒30分鐘。
7. 按下UV按鈕，關閉紫外燈，關閉電源。
注意事項：
1. 新安裝的或長期未使用的工作臺，使用前用超凈真空吸塵器或無塵布認真進行清潔工作。
2. 移門開啟高度一般不宜開啟過高（拉頂端）或關過低（落到臺面），以免影響風速和潔凈度。
3. 工作臺面上禁止存放無關的物品，以保持工作區的潔凈氣流不受干擾。
4. 禁止在工作臺面上記錄書寫，工作時應盡量避免做明顯擾動氣流的動作。
5. 禁止在預過濾器進風口部位放置物品，一面擋住進風口造成進風量減少，降低凈化能力。