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  • 發布時間:2020-07-21 09:02 原文鏈接: 超聲波破碎細胞的常見問題(一)

    大腸桿菌表達外源蛋白,在超聲破碎的時候,用含有1%triton-X-100的PBS懸浮,然后超聲的效果較好,1%triton-X-100的作用還是很明顯的,對其他的一些細菌同樣起作用,比如鏈霉菌。細菌沉淀直接加樣品1buffer,再加5ul的巰基乙醇,混勻,離心,煮沸10min,直接上樣,染色脫色步驟如下:將膠放入適量的染色液微波爐里加熱1min(下次適當補點醋酸即可),將染色液換成大量的水(自來水即可)在微波爐煮10min 就可以。

    在表達重組蛋白后超聲波破碎細胞,采用冰浴,400w,破2s停1s,但是不一會就產生大量泡沫,影響了破碎功率,pbs和tris緩沖液都是這樣,最后都是破碎不完全,而我的目的蛋白就在這些未破碎的細胞中。

    1*會產生氣泡是因為你的探頭位置沒放好。探頭一定要接近底部,約1cm(我一般是距底部0.5mm)。功率根據儀器不同會有所不同,但你可以觀察液面,有波動但不要太劇烈就好。

    2*破3S停10S,破個二三十次看看。

    3*變幅桿位置擺放也要注意,聽聲音如果不對的話就要及時調整。另外可以從菌濃度方面考慮。 在破碎時試著加大體積,強度最好不要超過60%.

    4*嘗試超8s停8s,對有些菌體蛋白來說,你的方法很難散熱,導致蛋白變性產生氣泡,最好停頓時間稍長一 些,這種情況多見于包涵體形式的蛋白。

    鏈霉菌(放線菌)超聲破碎的,用的方法條件是什么?

    前處理一般就是配置成一定濃度的菌懸液。

    使用超聲破碎時采用的具體條件是:

    (1)取細菌的24 h培養液于5 000 r/min 下離心5 min收集菌體.

    (2)用pH 7.5的Na2HPO -NaH2PO 緩沖液洗滌3次,再用該緩沖液將菌體配成1:3的菌懸液.置于40 mL大塑料試管內.

    (3)將大塑料試管置于冰浴中,采用超聲波破碎(功率200 W,1/2”探頭,破碎30 s,間歇30 S).

    (4)破碎液于12 000 r/min下高速冷凍離心30 min,收集細胞碎片和上清夜.

    超聲破菌流程與 上述基本一致,就是洗滌菌體也可以用預冷的生理鹽水或pH8的Tris-HCl,洗滌一次就 可以。另外,超聲劑量隨樣品量、菌體改變比較大,功率可以到400-600w,超5s,停5s,冰浴,要加終濃度1 mM的PMSF。為確定合適的超聲強度和次數,有必要隨時鏡檢觀察菌體是否完全破碎。

    放線菌屬于原核生物系統進化樹上的(G+C)摩爾百分含量(mol%)高的革蘭氏陽性菌 (Eubacteria)分枝類群,它雖然具有原核生物特有的分子生物學特性,但在其不同類群中,細胞壁的化學 組分變化很大。

    在做大腸桿菌超聲時,采用的是400W,超5停5的方法,效果不錯,但是用在鏈霉菌上,似乎沒什么效果。會不會就是由于細胞壁組成差異造成的呢,因為大腸桿菌式屬于革蘭氏陰性菌的。

    再有鏡檢是檢驗破碎效果,但是細胞破碎程度和我需要的酶獲得之間有正比關系嗎?破碎時間長也會影響到酶的活性。所以想問問anaisai戰友,你提供的“功率200 W,1/2”探頭,破碎30 s,間歇30 S”的條件好像是用于破碎鏈霉菌孢子的,也可以用于發酵離心后的菌泥嗎?如果可以,你破碎的全程時間大概是多少呢?

    如果你需要的是胞內酶,細胞破碎程度和需要的酶獲得之間基本上有正比關系。破碎時間長的確會影響到酶的活性。這就需要在最佳的破碎時間和酶活性之間做出判斷,最直接的辦法是先繪制相關曲線(酶活性和時間的關系曲線)。

    實驗中,破碎的是棒狀桿菌(也是很難破壁的G+菌),破碎時間控制在30min左右,酶活較好。

    如果是基質菌絲的話,好可以考慮用溶菌酶處理一下.


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