超濾器的維護與污染預防控制，首先要根據其膜材料和膜分離特點，從設計、工藝流程到設備操作運行、儲運和停機保養等各個環節加以考慮，制定維護與預防措 施，使濃差極化的影響和膜污染減少到最低程度。多年來，國內外在理論研究與應用實踐的基礎上，積累了不少行之有效的經驗和方法。
料液的有效處理
對料液（原水）采取有效的預處理，以達到膜組件進水的水質指標。如設計上在超濾器前先裝上孔徑為5～10μm的過濾器，以去除膠體、固體懸浮物及鐵銹等;或采用加入某類凝絮劑，進行預凝絮、預過濾;或改變溶液pH值等方法，以脫除一些能與膜相互作用的溶質。
改善力學條件
改善膜面附近料液（原水）側的流體力學條件。如提高超濾器的進水流速以增大膜面水流速度，或采用湍流促進器和設計合理的流道結構等方法，使被截留的溶質及時地被水流帶走。
日常沖洗
一般在超濾結束后向整個超濾系統注入清洗用水，排出料液（原水）進行沖洗1可采用等壓沖洗或壓差反洗（后者適宜中空纖維超濾器）。多少時間沖洗一次，每次沖洗時間是多少，要根據料液（原水）的實際情況和試驗來確定。
減少結構死角
在超濾設備設計中，除考慮清洗的要求外，還應注意減少設備結構中的死角和死空間間隙，以防止滯留物在此變質，擴大膜污染。
適當提高水溫
（以采用的超濾膜所允許的最高溫度為限），加速分子擴散，增大濾速;或降低膜兩側的壓差或料液濃度，均可減輕已經產生的濃差極化現象。
消毒試劑的使用
為防止微生物、細菌及有機物的污染，常使用消毒試劑，如含氯試劑、過氧化物、碘化物等。一般每月需用濃度為1%～2%的H2O2清洗膜一次。
長期停用
（5d以上）、長期保管時，在設備中需用0。5%甲醛液浸泡。若保管三個月以上時，尚需每月用H2O2清洗一次。
膜的清洗與保養
在膜清洗保養中的最基本原則是不能讓膜變干。儲運、保存和不運轉時每個組件也應充水，使膜保持濕潤狀態。
膜面預處理
研究表明，在超濾前將膜表面進行適當的預處理，對減少膜面吸附有極大的幫助。例如，以一種對膜的分離特性不會產生很大影響的小分子化合物覆蓋住膜面，形成保護層，防止膜表面和料液中某些組分起作用。同時，它還可防止酶在膜處理過程中的失活。
膜的保存
膜是超濾器的關鍵部分，保存也很重要。不同的膜有不同的要求。對于聚砜中空纖維膜，停止運行時必須在濕態下保存，并以防腐溶液浸泡。對于醋酸纖維膜，為 使其水解降低至最低限度，保存于pH=4。5～5的去離子水中為宜，一般添加0。5%的甲醛溶液。對于芳香聚酰胺類膜，保存方法報道較少;但考慮水中游離 氯容易導致該膜破壞，所以最好不要放在自來水中，而應保存在離子水中。另外，根據實際水質和水處理要求，注意選擇膜材料，因為對溶質有強烈吸附的膜易被污 染和堵孔，且不易清洗。從抗污染的角度，預先考慮選擇膜材料也是比較重要的。