軀體感染伴發的精神障礙總的診斷根據是：
1.現病史中有明顯的急性感染史，在體檢或細菌免疫學檢查中可發現感染時的各種陽性所見。
2.精神癥狀以意識障礙為主，其中尤以譫妄狀態更為多見。
3.精神癥狀往往是繼發于感染之后，因而常隨軀體疾病的變化而變化。
4.符合原發感染疾病的診斷標準。例如：
（1）流行性出血熱所致精神障礙診斷依據：
①現病史中有明顯的急性感染史，在體檢或細菌免疫學檢查中可發現感染時相應的陽性所見。
②精神癥狀以意識障礙為主，其中尤以譫妄狀態為多見。
③精神癥狀繼發于感染之后，常隨軀體疾病的變化而變化。
（2）傷寒，副傷寒伴發的精神障礙診斷依據：
①現病史中有明顯的急性感染史，在體檢或細菌免疫學檢查中可發現感染時相應的陽性所見。
②精神癥狀以意識障礙為主，其中尤以譫妄狀態為多見。
③精神癥狀繼發于感染之后，常隨軀體疾病的變化而變化。
（3）HIV診斷：
①在具有適當診斷技術條件的情況下，通過可靠的方法，確診病人具有1種或幾種表明有細胞免疫缺陷的機會性感染及少見的惡性腫瘤，排除已知的其他能引起細胞免疫缺陷和機體抵抗力降低的原因，即完全符合艾滋病定義者。
②在診斷條件受限時，下列情況可做診斷。
A.至少具有2種主要病征和至少1種次要病征，而無已知的引起免疫抑制原因或其他已知原因。
B.主要病征：體重減輕超過標準體重10%以上；慢性腹瀉超過1個月以上；長期發熱，超過1個月。
C.次要病征：持久咳嗽超過1個月，全身瘙癢性皮炎，反復發作的帶狀皰疹，口咽部念珠菌病，慢性進行性及播散性單純皰疹感染；全身淋巴結病。
D.全身性卡波濟氏肉瘤或隱球菌性腦膜炎者可診斷為艾滋病。
③可做病毒分離及血清學檢查，病原及血清抗體試驗陽性，腦脊液檢查為非特異性蛋白增多，淋巴細胞增多，糖減低。
④腦成像檢查，CT檢查可見腦皮質萎縮，MRI檢查有典型的皮質萎縮及中央白質密度減低。
⑤腦電圖檢查可有異常。
⑥發病的高危人群，是同性戀者，靜脈藥物成癮者，血友病患者，及與艾滋病毒攜帶者有性接觸者。