纖維胃鏡檢查
纖維胃鏡的檢查對診斷有重要意義，它可明確地作出胃炎與潰瘍的鑒別診斷。但在施行BillrothⅡ式手術或胃空腸吻合術后發生于吻合口空腸側的潰瘍常不易被發現，須仔細觀察，最好選用側視型內窺鏡。BillrothⅠ式手術后的復發潰瘍多位于吻合口之胃側。用不吸收縫線作吻合，有時可出現縫線膿腫，亦可產生類似潰瘍的癥狀。有時在胃鏡下可觀察到吻合口潰瘍之中心即為不吸收之縫線。
X線檢查
上消化道鋇餐造影檢查對邊緣潰瘍之診斷不如對胃或十二指腸潰瘍的診斷可靠。一般認為僅有50%左右的準確率，因此鋇餐造影檢查陰性，并不能排除邊緣潰瘍。吻合口潰瘍在鋇餐造影檢查時并不一定出現龕影，有時可根據吻合口的壓痛和激惹即可做出診斷。
在術后近期行鋇餐造影檢查，常將正常吻合口的突起或缺損誤診為吻合口潰瘍，這是由于吻合口的水腫或吻合口縫線的影響所形成的假象所致。因此，術后的鋇餐檢查以6～8周為宜。