在種子調運的過程中，如果種子中帶有害蟲，那么就會為傳播危險性病、蟲提供途徑，造成嚴重的生產隱患，因此為了提高生產品質，保障生產成果，就需要檢測種子是否帶有害蟲，傳統的檢測方式是采取抽樣逐粒解剖的方法，而現在是運用種子軟X射線儀來檢驗種子是否帶有害蟲，兩種方式相比，種子軟X射線儀這種檢測方式優勢明顯，它具備操作簡便、迅速,不損壞種子以及跟蹤觀察等優點。
傳統的抽樣逐粒解剖的方法既費工費時，又要損壞一定數量的種子，而種子軟X射線儀不需要損壞種子，只需要從熒光屏上或通過攝影分析照片，就能夠分辨出受檢樣品內是有害蟲存在，以及害蟲的形態、種類等，不僅實用性更強，而且效率也更高，因此將其用于現代林木種實害蟲檢疫工作中，取得了不錯的成效。
而之所以運用種子軟X射線儀可以檢驗種子是否帶有害蟲，一方面是軟X射線透視、攝影技術發展的比較成熟，另外一方面是因為種實和害蟲的組成物質不同，因此通過種子軟X射線儀透射之后的成效效果也不同，比如種實主要是由淀粉、脂肪、纖維素和灰分組成；害蟲主要是由蛋白質和脂肪組成。健康的種實，其組成物質均勻有序、密度較大，透過的X射線較少；而內有害蟲的種實組織，其密度遠較健康種實小，透過的X射線則較多。根據這些不同的特點，檢測人員只需要根據圖像或者是拍攝的圖片就能夠分別出那些是帶有害蟲的種類，那些是健康的種粒，甚至是分辨出害蟲種粒中的害蟲形態種類等信息，大大方便了隱蔽性林木種苗害蟲檢驗工作的開展，保障了種子健康和農業生產安全。