（1）提高產量。與分批滅菌相比培養液受熱時間短，可縮短發酵周期，同時培養基成分破壞較少。
（2）產品質量較易控制。
（3）蒸汽負荷均衡，鍋爐利用率高，操作方便。
（4）適宜采用自動控制。
（5）降低勞動強度。
在連續滅菌過程中，蒸汽用量雖平穩，但氣壓一般要求高于0.5Mpa（表壓）。連消設備比較復雜，投資較大。采用連續滅菌時，發酵罐應在連續滅菌開始前先進行空消，以容納經過滅菌的培養基。加熱器、維持罐和冷卻器也應先進行滅菌，然后才能進行培養基連續滅菌。組成培養基的耐熱性物料和不耐熱性物料可在不同溫度下分開滅菌，以減少物料受熱破壞的程度，也可將糖和氮源分開滅菌，以免醛基與氨基發生反應而生成有害物質。對于粘度過高或固體成分較多的培養基要實現連消困難較多，主要是滅菌的均勻度問題。設計這類物料的連消設備必須避免管道過長，或盡可能將淀粉質物料先行液化。
由于滅菌過程是加熱和冷卻的過程，所以這些設備所組成的流程并不是固定的。如采用噴射加熱器加熱而采用真空冷卻有困難，也可采用其它冷卻方式（如噴淋冷卻器或板式換熱器等）。