透明細胞癌的真正起因仍不能確定，認為能夠引起透明細胞癌的有：放射線，包括太陽光，游離性輻射品，如鈾、鐳、紫外光線。可引起皮膚癌、骨癌和血液方面的癌癥。化學物質
空氣污染與吸煙
：產生碳氧化合物，易刺激呼吸道，引起肺透明細胞癌。飲食的不當：如嗜吃酸辣食物或腌浸蔬菜，易得胃透明細胞癌，而一些食品添加劑和著色劑，也可能導致透明細胞癌。高脂肪食物可能與大腸透明細胞癌、乳腺透明細胞癌有關。
食物貯藏方式
：一些發霉食物如醬類或干濕物上長有真菌，進而產生霉素，可能引起透明細胞癌。尤其是黃曲霉素，已被證實與肝透明細胞癌關系密切。
某些藥物
，例如荷爾蒙，也被懷疑與乳透明細胞癌、子宮透明細胞癌有關。
個人習慣
1、吸煙者比不吸煙者易患肺透明細胞癌20倍，口腔癌3-10倍，喉癌3-17倍。2、性生活的多少與婦女子宮透明細胞癌有關。
濾過性病毒與寄生蟲
。一部分血液及淋巴癌癥與病毒有關。軟部腫瘤、子宮頸癌、鼻咽癌亦然。