植物細胞或原生質體線粒體DNA分離(物理法)
實驗開始前,將試劑盒里的凈化液(Reagent C)凍融,然后移出1毫升凈化液(Reagent C)和4毫升的裂解液(Reagent B)到15毫升錐形離心管里,混勻后,標記為裂解工作液,置入冰槽里備用。然后進行下列操作。
準備5 X 107植物細胞或原生質體
移入一個50毫升錐形離心管
放入臺式離心機離心10分鐘,速度為200g
小心抽去上清液
加入5毫升預冷的清理液(Reagent A),混勻細胞
放入臺式離心機離心10分鐘,速度為300g
小心抽去上清液
加入預冷的5毫升裂解工作液
渦旋震蕩5秒,充分混勻細胞顆粒群
即刻放入預冷的DOUNCE勻漿器,在冰槽里用勻漿棒勻化細胞(約80下)(注意:參見注意事項7)
將所有細胞勻漿物移入15毫升錐形離心管,放入4℃臺式離心機離心10分鐘,速度為1500g
小心移出上清液(注意:不要觸碰沉淀物)到另一個新的預冷的15毫升錐形離心管(如果上清液含有肉眼可見的殘渣,重復離心5分鐘一次,速度為3000g)——此步驟去除細胞壁、淀粉顆粒、細胞核和未溶解的細胞以及完整質體等殘渣
放入4℃超速離心機離心10分鐘,速度為10000g
小心抽去上清液,保留沉淀顆粒——此步驟獲得線粒體沉淀物(注意:如果暫時停止操作,須暫時放進-70℃冰箱里)
加入300微升破膜液(Reagent F)到線粒體顆粒樣品中
渦旋震蕩15秒,混勻顆粒群
轉入1.5毫升離心管
置入冰槽中孵育15分鐘
加入30微升去干擾液(Reagent G)
用200微升槍頭上下抽吸混勻
放進37℃恒溫水槽孵育15分鐘
加入30微升酶解液(Reagent H)
渦旋震蕩15秒
放進58℃恒溫水槽或干式培養儀孵育2小時
置于室溫下冷卻15分鐘,直至處于室溫狀態(或置于冰槽里15至30秒)
加入300微升萃取液(Reagent I)(注意:使用前搖勻)
渦旋震蕩5秒
放進微型臺式離心機離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
移出上層液相溶液到新的1.5毫升離心管(注意:切莫觸碰液相交界面上的白色膜狀物)
加入100微升濃縮液(Reagent J)到新的離心管
加入1微升助沉液(Reagent K)
加入800微升沉淀液(Reagent L)
在渦旋震蕩儀上震蕩5秒,充分混勻
放進微型臺式離心機離心15分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)(注意:離心前做好方位標記,以便離心后觀察管底沉淀顆粒)
小心抽掉上清液
加入1毫升純化液(Reagent M)
放進微型臺式離心機離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
小心抽掉上清液
空氣中晾干沉淀顆粒群
加入20微升緩沖液(Reagent N)
溶解后放進-20℃冰箱長期保存或移出2微升進行PCR反應
植物細胞或原生質體線粒體DNA分離(化學法)
實驗開始前,將試劑盒里的凈化液(Reagent C)凍融,然后移出1毫升凈化液(Reagent C)和4毫升的裂解液(Reagent B)到15毫升錐形離心管里,混勻后,標記為裂解工作液,置入冰槽里備用。然后進行下列操作。
準備5 X 107植物細胞或原生質體
移入一個50毫升錐形離心管
放入臺式離心機離心10分鐘,速度為200g
小心抽去上清液
加入5毫升預冷的清理液(Reagent A),混勻細胞
放入臺式離心機離心10分鐘,速度為300g
小心抽去上清液
加入預冷的5毫升裂解工作液
渦旋震蕩5秒,充分混勻
(選擇步驟)超聲波處理1分鐘
在冰槽里孵育2分鐘,期間渦旋震蕩5秒一次
加入預冷的500微升強化液(Reagent D)
渦旋震蕩5秒,充分混勻
在冰槽里孵育5分鐘,期間渦旋震蕩5秒二次(注意:參見注意事項8)
加入預冷的5毫升保存液(Reagent E),輕輕搖動試管混勻
放入4℃臺式離心機離心10分鐘,速度為1500g
小心移出上清液(注意:不要觸碰沉淀物)到另一個新的預冷的15毫升錐形離心管(如果上清液含有肉眼可見的殘渣,重復離心5分鐘一次,速度為3000g)——此步驟去除細胞壁、淀粉顆粒、細胞核和未溶解的細胞以及完整質體等殘渣
放入4℃超速離心機離心10分鐘,速度為10000g
小心抽去上清液,保留沉淀顆粒——此步驟獲得線粒體沉淀物(注意:如果暫時停止操作,須暫時放進-70℃冰箱里)
加入300微升破膜液(Reagent F)到線粒體顆粒樣品中
渦旋震蕩15秒,混勻顆粒群
轉入1.5毫升離心管
置入冰槽中孵育15分鐘
加入30微升去干擾液(Reagent G)
用200微升槍頭上下抽吸混勻
放進37℃恒溫水槽孵育15分鐘
加入30微升酶解液(Reagent H)
渦旋震蕩15秒
放進58℃恒溫水槽或干式培養儀孵育2小時
置于室溫下冷卻15分鐘,直至處于室溫狀態(或置于冰槽里15至30秒)
加入300微升萃取液(Reagent I)(注意:使用前搖勻)
渦旋震蕩5秒
放進微型臺式離心機離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
移出上層液相溶液到新的1.5毫升離心管(注意:切莫觸碰液相交界面上的白色膜狀物)
加入100微升濃縮液(Reagent J)到新的離心管
加入1微升助沉液(Reagent K)
加入800微升沉淀液(Reagent L)
在渦旋震蕩儀上震蕩5秒,充分混勻
放進微型臺式離心機離心15分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)(注意:離心前做好方位標記,以便離心后觀察管底沉淀顆粒)
小心抽掉上清液
加入1毫升純化液(Reagent M)
放進微型臺式離心機離心5分鐘,速度為16000g(或13000RPM,例如eppendorf 5415)
小心抽掉上清液
空氣中晾干沉淀顆粒群
加入20微升緩沖液(Reagent N)
溶解后放進-20℃冰箱長期保存或移出2微升進行PCR反應
注意事項
本產品為20次操作(1克植物組織或5 X 107細胞)
線粒體操作均須在4℃或以下狀態下進行
操作時,須無菌操作,避免污染母液,尤其是裂解液(Reagent B)和保存液(Reagent E)
建議使用足夠的組織或細胞量
建議植物組織使用組織勻漿器操作;德國的BRAUN細胞勻漿器最為理想
建議嚴格控制操作時間
通常勻化次數為80下(或細胞顆粒群/組織塊狀消失為止)達到80%的細胞裂解為理想狀態,但不同的組織或細胞類型會存在差異。用戶可以通過顯微鏡觀察3微升勻漿物的細胞裂解程度:完整細胞呈現發亮的圓環。低于50%可以增加勻化次數。
通常孵育5分鐘達到80%的細胞裂解為理想狀態,但不同的組織或細胞類型會存在差異。用戶可以通過顯微鏡觀察3微升裂解物的細胞裂解程度:完整細胞呈現發亮的圓環。低于50%可以增加孵育時間和渦旋震蕩次數
裂解液(Reagent B)具有吸附去除酚類物質的作用
不同組織,其線粒體含量不同;通常1克植物組織的線粒體含量為10至50微克線粒體蛋白
試劑中的溶液使用前搖勻;酶解液(Reagent H)需放進37℃凍溫育許;為避免反復凍融,建議適量分裝
通常1克植物組織或5 X 107細胞中提取的線粒體DNA達1至10微克
本產品所獲得的線粒體DNA純度和產量最為理想,確保無核DNA和外源性DNA污染
本公司提供系列植物線粒體分析技術產品