1、植物來源不同：通草是五加科植物通脫木的干燥莖髓，小通草為旌節花科植物喜馬山旌節花、中國旌節花或山茱萸科植物青莢葉的干燥莖髓。二者來源于不同的植物；
2、功效不同：通草味甘、淡，性微寒，具有清熱利尿、通氣下乳的作用，臨床上常用于治療濕熱尿赤、水腫尿少、小便刺痛以及乳汁不下等癥狀，但側重于治療乳汁不下；而小通草味甘、淡，性寒，能夠清熱、利尿、下乳，但不能夠通氣，臨床上常用于治療小便不利、乳汁不下等病癥，雖與通草的治療作用相同，但更側重于利尿。
