通過qPCR開展基因表達譜分析

發布時間：2012-08-17 00:00 原文鏈接：通過qPCR開展基因表達譜分析

　　一提起基因表達譜分析，大家馬上會想到芯片。然而，并不是每個實驗室都具備這個條件。現在，利用每個實驗室都有的定量PCR儀，也能開展可靠的基因表達譜分析啦。

　　QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一種高度可靠且靈敏的基因表達譜分析技術，它利用實時定量PCR分析信號轉導、生物過程或疾病研究通路中聚焦的一組基因。

　　目錄上的每個RT2 Profiler PCR Array都包含一列通路聚焦的基因以及5個看家(參考)基因。此外，每個陣列還包含一組ZL的對照，以監控基因組DNA污染(GDC)以及第一鏈合成(RTC)和實時定量PCR的效率(PPC)。

　　為什么要使用RT2 Profiler PCR Array?

　　- 簡約：RT2 Profiler PCR Array的簡約讓常規的表達譜分析可在任何科研實驗室的實時定量PCR儀上實現。

　　- 性能：RT2 Profiler PCR Array具有靈敏度、重復性、特異性和可靠性，可準確地以96和384孔板、100孔盤管和96x96芯片形式同時分析多個基因。

　　- 關聯：RT2 Profiler PCR Array著重分析對您的研究很重要的通路或疾病狀態相關的基因。

圖1. RT2 Profiler PCR Array中的每孔測定了與通路或疾病狀態相關的基因的表達。

圖2. Common Cytokine RT2 Profiler PCR Array鑒定出PBMC刺激后23個上調的基因和6個下調的基因。

　　RT2 Profiler PCR Array系統如何工作

　　RT2 Profiler PCR Array是一個完整的系統，適用于通路聚焦的基因表達分析。從樣品制備到數據分析，RT2 Profiler PCR Array系統包含了四個組分，可保證高質量、重復可靠的基因表達數據。

　　作為RT2 Profiler PCR Array系統性能中不可缺少的一部分，一組ZL的對照元素可增強數據的可靠性，且隨著時間的推移，可充當性能的保證。這些元素讓研究人員能夠確定樣品是否被基因組DNA(gDNA)所污染，逆轉錄反應的質量和實時定量PCR的效率，從而快速評估數據的質量。RT2 Profiler PCR Array系統中的每個組分都融入了一個聯鎖系統(interlocked system)，有助于這些質量對照元素，以便全面監控過程中的每一步。

　　1. RT2 Profiler PCR Array

　　每個通路聚焦的RT2 Profiler PCR Array都包含89個實驗室驗證過的RT2 qPCR Primer Assay(包括5個看家基因)和1個ZL的對照板。

　　2. RT2 SYBR Green qPCR Mastermixes

　　隨引物設計算法而演化的緩沖液獨特配方帶來了高的擴增效率。目前有參考染料可供選擇(ROX、熒光素或不含)。

　　3. RT2 First Strand Kit

　　RT2 Profiler PCR Array所檢測的外部RNA對照檢驗了起始RNA的質量。它還特有一款ZL的基因組DNA去除緩沖液，這對去除殘留gDNA、確保mRNA的特異檢測很關鍵。

　　4. 免費的數據分析軟件

　　RT2 Profiler PCR Array 在大的檢測范圍內評估一組通路聚焦的基因表達的能力產生了大量的數據。有了我們免費的RT2 Profiler PCR Array數據分析工具，原始CT值到倍數變化的結果都能在幾分鐘內以各種形式(散點圖、火山圖、聚類圖)表現。