遺傳標記指可追蹤染色體、染色體某一節段、某個基因座在家系中傳遞的任何一種遺傳特性。它具有兩個基本特征，即可遺傳性和可識別性，因此生物的任何有差異表型的基因突變型均可作為遺傳標記。
傳標記在重組實驗中多用于測定重組型和雙親型。作為標記基因，其功能不一定研究得很清楚但應突變性狀是明確的，所以容易測定。對于微生物雖多用與生化性狀有關的基因，但對高等生物則多用與形態性狀有關的基因。也有用著絲粒作為遺傳標記的。在微生物遺傳學中遺傳標記還區分為選擇性標記（或稱選擇性基因）和非選擇性標記（或稱選擇性基因）二類。