根據轉化細胞中的復制機制，可將酵母質粒載體分為兩個基本類型即整合載體和自我復制載體。
選擇酵母載體的必須慎重考慮以下幾個標準：
①大腸桿菌和酵母均有適當的遺傳標志；
②結合實際需要，考慮在酵母中的復制方式；
③在酵母和大腸桿菌中的拷貝數；④要有簡單易行的篩選插入物的方式。
