重組腺病毒構建，擴增及純化基本技術操作
（細菌內同源重組AdEasy System）
一 目的基因的克隆（以pshuttle-CMV質粒為例）
1. 選擇適當酶切位點，進行酶切連接，將目的片段插入pshuttl-CMV質粒多克隆位點。
2. 重組質粒鑒定： 酶切鑒定或測序。
3. 重組質粒擴增，純化并準備適量含目的基因的穿梭質粒。
4. 用PmeI單酶切線性化重組穿梭質粒，電泳鑒定質粒完全被切開。
5. 膠回收線性化質粒，以備共轉化使用。
二 共轉化
1 大腸桿菌BJ5183電轉感受態制備
2 從新鮮瓊脂板上挑取單個BJ5183細菌，接種于LB培養基中，37℃振搖過夜。
2 接種25ml過夜培養物于500ml LB培養基，37℃振搖，至OD600 達到0.4。
2 迅速將培養物置于冰浴中30min，至充分冷卻。
2 將菌液轉移至預冷的離心管中，4℃下以2500r/min離心15 min，棄培養液，回收細胞。
2 以10ml預冷的10%甘油洗滌沉淀，低溫離心，共兩次。
2 加約1ml（適量）預冷的10%甘油重懸沉淀，稀釋懸液100倍，測量OD600，至稀釋濃度為2-3×1010個細胞/ ml (1.0 OD600約2.5×1010個細胞/ml)。分裝，-80℃或液氮保存待用。
2 病毒骨架質粒轉化大腸桿菌，擴增，純化。
3 將1-5μl (約1μg) 線性化的穿梭質粒及1μl（約100ng/μl）病毒骨架質粒（如pAdEasy-1）加入至含約40μl BJ5183電轉感受態的EP管中混勻,冰上冷卻。
4 將混合物加入電轉杯，電擊（1250-1500V/mm,5ms）。
5 電擊結束取出樣品，加入1ml SOC或LB培養液，37℃低速振蕩40min。
6 取適當體積的電擊轉化細胞液涂于數個卡那霉素抗性平板（25-50mg/ml），37℃培養16-20hr。
7 次日挑取平板上長出的菌落（選擇最小的菌落）,接種于3ml含25-50mg/ml的LB培養基，37℃培養10-15hr。
8 堿裂法提取質粒，0.8%瓊脂糖凝膠電泳篩選，大質粒為可能陽性克隆，進一步酶切鑒定。以PacI單酶切，0.8%瓊脂糖凝膠電泳如顯示出一條大片段（約30kb）,及一條小片段（約3.0或4.5kb）（同時可進行其它酶切鑒定），則基本確定為陽性克隆。
9 取1-5μl 陽性質粒轉化至DH5α大腸桿菌細胞（BJ5183為recA+,質粒DNA易發生突變，DH5α或JM109，XL1-blue菌株為重組缺陷性菌株，可穩定擴增已鑒定的重組質粒），擴增細菌并純化質粒。
三 重組病毒質粒轉導293細胞
1 293細胞培養：轉導24小時前，以方瓶為例，接種2×106 293細胞于25cm2方瓶，使生長密度約50-70%。（也可以使用6孔或96孔板）
2 以PacI單酶切重組病毒質粒（轉導25cm2方瓶約需4μgDNA），完全線性化后，乙醇沉淀，再以20 μl ddH2O溶解。
3 脂質體包裹質粒（以Lipofectamine為例）:每4μg PacI約需20μl Lipofectamine包裹.質粒及脂質體分別稀釋于500μl無血清培養基再混合,置于室溫下15-30min。
4 以無血清培養基輕輕洗滌培養瓶，另加2.5ml無血清培養基，37℃放置10min。
5 將Lipofectamine-DNA混合物加入培養瓶，37℃孵箱放置4hr。
6 4hr后，棄Lipofectamine-DNA混合液，另加入6ml DMEM完全培養基（含10% FCS）。如有大量細胞漂浮，可不棄Lipofectamine-DNA液，加入6ml DMEM完全培養基，37℃孵育過夜，再換液。
7 培養過程中觀察細胞生長情況。約2周后可觀察到細胞病變（CPE）出現（如用pAdTrack-CMV質粒，由于含GFP，可觀察到綠色熒光）。
四 重組病毒鑒定
1 轉導10-14d后，收集細胞沉淀，加入2ml滅菌的PBS混懸，凍融細胞，離心后收集上清保存于-80℃。
2 取30-50% 步驟1中上清，感染50-70%飽和度的25cm2方瓶中293細胞。2-3d后出現明顯細胞病變。
3 感染后3-5d,當1/3-1/2細胞漂浮時收集病毒。按步驟1收集細胞并準備病毒上清。通過Western blot和/或PCR鑒定重組腺病毒產生。
4 PCR鑒定重組病毒。取5μl病毒上清加入10μl蛋白酶K，55℃孵育1hr，再煮沸5min，離心后取1-2μl作PCR。
五 重組病毒擴增，純化
1 75cm2方瓶中接種293細胞，至密度達到90%，加入適量病毒上清感染細胞。3-4d后，細胞幾乎變圓，且有一半細胞漂浮，則收集所有細胞。約500g轉速離心，棄上清。
2 以滅菌PBS重懸沉淀，反復凍融4次。4℃下7000g離心5min.病毒純化至少需要30瓶75cm2方瓶細胞。
3 CsCl連續梯度離心純化：50ml離心管中稱量4.4g CsCl，加入8ml病毒裂解上清液，混勻，體積約為10ml。轉移至12ml超速離心管（用于SW41轉頭）中，覆蓋約2ml礦物油。平衡后，10℃下32000 rpm離心18-24hr，用注射器抽吸離心出的病毒帶。
（也可CsCl不連續梯度離心：20ml超速離心管中緩慢加入8ml CsCl 1.4 (53 g + 87 mL 10 mM Tris-HCl，pH=7.9)，上面小心加入6 mL CsCl 1.2 (26.8 g + 92 mL 10 mM Tris-HCl，pH=7.9)，再小心加入病毒上清液至體積達到20ml。平衡后，4℃下 23000rpm離心90min (SW28轉頭)，用注射器抽吸下層藍白色病毒帶）
4 病毒透析去鹽：配置透析液（10 mM Tris pH 8.0, 2 mM MgCl2, 5% sucrose），滅菌處理。4℃透析，更換3次透析液，可基本去除CsCl，病毒保存于-80℃。
六 病毒滴度測定（TCID50）
1 細胞準備:96孔板中接種100μl 293細胞,每孔細胞數約104個,以2% DMEM培養
2 稀釋病毒液準備：以2% DMEM將病毒液稀釋成8個較高濃度（如10-3-10-10），每個濃度重復10個，每孔加入病毒稀釋液100μl。另留兩排不加病毒液作為陰性對照。37℃下，孵箱培養10天。
3 10d后觀察細胞，記數每排出現CPE的孔數，計算細胞病變率。（如某一濃度各孔細胞全部病變，比率為1，如無細胞病變，則比率為0）。
4 計算T =10×101 + d (S - 0.5) /ml
d = Log 10 稀釋度（如為10倍稀釋℃，d=1）
S = 各濃℃細胞病變比率之和
實驗室重組腺病毒常用質粒：病毒骨架質粒：pAdEasy-1, pAdEasy-2
穿梭質粒：p-Shuttle, p-Shuttle-CMV, pAdTrack, pAdTrack-CMV