以利用轉基因動物的乳腺表達重組蛋白質為例：其方法是將藥用蛋白基因與乳腺蛋白基因的啟動子等調控組件重組在一起，通過顯微注射等方法，導入哺乳動物（哺乳動物才會泌乳）的受精卵中，然后，將受精卵送入母體內，使其生長發育成轉基因動物。轉基因動物進入泌乳期后，可以通過分泌的乳汁來生產所需要的蛋白質藥品，因而稱為動物乳腺生物反應器或乳房生物反應器。科學家已在牛和山羊等動物的乳腺生物反應器中表達出了抗凝血酶、血清白蛋白、生長激素和α-抗胰蛋白酶等重要的醫藥產品。
重組蛋白質在制藥工業上主要是指表達獲得的細胞因子、凝血因子或者人工設計的蛋白分子。