高錸酸銨具有一系列獨特的化學性質。
首先，它在加熱至365℃時會分解，這一性質使得高錸酸銨在制備金屬錸粉等過程中具有重要的作用。
其次，高錸酸銨在水中的溶解度隨著溫度的升高而增加，這一性質為其在化學實驗和工業生產中的溶解和提純提供了可能。
此外，高錸酸銨還具有較強的氧化性，能夠作為氧化劑參與多種化學反應。此外，高錸酸銨與一些物質會發生特定的化學反應。
例如，它與有機物、還原劑、硫、磷以及易燃或可燃物混合時，能形成爆炸性混合物，因此在儲存和使用過程中需要特別注意安全。
此外，高錸酸銨與氫、氮、碳等元素在一般條件下不反應，但錸粉能吸收氫氣，這為其在某些特定領域的應用提供了可能性。