磷酸鹽一般會用在清潔劑中作為軟水劑，但是因為藻類的繁榮衰退周期會影響磷酸鹽在分水嶺的排放，所以在某些地區磷酸鹽清潔劑是受到管制的。
在農業上，磷酸鹽是植物的三種主要養分之一，且是肥料的主要成份。磷礦粉是從沉積巖的磷層中開采。以前它在開采后不用加工便可使用，但現時未加工的磷酸鹽只會用在有機耕種上。一般它都是會化學加工制成過磷酸石灰、重過磷酸鈣或磷酸二氫銨，它們的濃度都較磷酸鹽高，且較易溶于水，所以植物可以較快吸收。
肥料級數一般有三個數字：第一個是指氮的數量，第二個是指磷酸鹽的數量，而第三個是指堿水。所以一個10-10-10的肥料就每種成份各有10%，而其他的則是填充物。
從過度施肥的農地逕流的磷酸鹽會是富營養化、赤潮及其后缺氧的起因。這就像磷酸鹽清潔劑一樣會引起魚類及其他水中生物的缺氧癥。