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  • 發布時間:2020-05-25 10:37 原文鏈接: 長鏈非編碼RNA:從科研到臨床(三)

    腎臟疾病與糖尿病 

    糖尿病經常伴隨著腎病的發生[5]. 比如基因間lncRNA PVT1與二類疾病都緊密關聯。研究人員在II型糖尿病人的晚期腎病進程中發現了PVT1的基因變異。高糖處理可以誘導人的腎間質細胞中PVT1和纖連蛋白1、IV型膠原蛋白、TGFβ1、PAI1等因子的高表達。相反,敲除PVT1可導致這些因子的顯著下調。

    LncRNA與臨床應用

    普遍認為lncRNA具有區分不同細胞狀態或細胞內生物過程的功能,因此可以用來鑒定病理過程、提供預后評估或者為個體化療法提供參考。其表達的時空特異性和疾病特異性使其有望成為強有效的分子標志物。已有不少研究揭示,lncRNA在多種疾病生物學標志物的應用中具備潛能(表二)。例如,研究發現LncRNA MTLIPCAR在發生左心室重塑的病人中特異性表達,并隨后在788個發生心臟重塑和心臟衰竭的病人中得到驗證。血液循環系統中的MTLIPCAR高表達水平可不受其他心血管疾病標志物的干擾,獨立預測惡性心臟重塑。這項研究充分表明循環lncRNA具有作為分子標志物的重大潛能。

    LncRNA

    Disease Association

    Biomarker application

    CDKN2B-AS1

    Coronary artery disease[11, 12]

    Risk factor

    CDKN2B-AS1

    Myocardial infarction[12]

    Risk factor

    KCNQ1OT1

    Myocardial infarction[13]

    Predicts left ventricular dyfunction

    MIAT

    Myocardial infarction[14]

    Risk factor

    MT-LIPCAR

    Myocardial infarction[15]

    Predicts postinfarct remodelling

    SOX2OT

    Alzheimer’s disease[16]

    Risk factor

    H19

    Parkinson’s Disease[17]

    Risk factor

    HULC

    Hepatocellular carcinoma[18]

    Diagnosis and monitoring

    FALEC

    Ovarian cancer[19]

    Predicts poor prognosis

    CCAT1

    Colorectal cancer[20]

    Predicts therapeutic responsiveness

                     表一 LncRNA在生物學標志物中的潛在應用



    參考文獻

    [1] Fatica A, Bozzoni I. Long non-coding RNAs: new players in cell differentiation and development. Nature reviews Genetics 2014;15:7-21.

    [2] Devaux Y, Zangrando J, Schroen B, Creemers EE, Pedrazzini T, Chang CP, et al. Long noncoding RNAs in cardiac development and ageing. Nature reviews Cardiology 2015;12:415-25.

    [3] Satpathy AT, Chang HY. Long noncoding RNA in hematopoiesis and immunity. Immunity 2015;42:792-804.

    [4] Knoll M, Lodish HF, Sun L. Long non-coding RNAs as regulators of the endocrine system. Nature reviews Endocrinology 2015;11:151-60.

    [5] Lorenzen JM, Thum T. Long noncoding RNAs in kidney and cardiovascular diseases. Nature reviews Nephrology 2016;12:360-73.

    [6] Schmitt AM, Chang HY. Long Noncoding RNAs in Cancer Pathways. Cancer cell 2016;29:452-63.

    [7] Schmitz SU, Grote P, Herrmann BG. Mechanisms of long noncoding RNA function in development and disease. Cellular and molecular life sciences : CMLS 2016;73:2491-509.

    [8] Ghosal S, Das S, Chakrabarti J. Long noncoding RNAs: new players in the molecular mechanism for maintenance and differentiation of pluripotent stem cells. Stem cells and development 2013;22:2240-53.

    [9] Chen Z. Progress and prospects of long noncoding RNAs in lipid homeostasis. Molecular metabolism 2016;5:164-70.

    [10] Wu P, Zuo X, Deng H, Liu X, Liu L, Ji A. Roles of long noncoding RNAs in brain development, functional diversification and neurodegenerative diseases. Brain research bulletin 2013;97:69-80.

    [11] Consortium CAD, Deloukas P, Kanoni S, Willenborg C, Farrall M, Assimes TL, et al. Large-scale association analysis identifies new risk loci for coronary artery disease. Nature genetics 2013;45:25-33.

    [12] Samani NJ, Erdmann J, Hall AS, Hengstenberg C, Mangino M, Mayer B, et al. Genomewide association analysis of coronary artery disease. The New England journal of medicine 2007;357:443-53.

    [13] Vausort M, Wagner DR, Devaux Y. Long noncoding RNAs in patients with acute myocardial infarction. Circulation research 2014;115:668-77.

    [14] Ishii N, Ozaki K, Sato H, Mizuno H, Saito S, Takahashi A, et al. Identification of a novel non-coding RNA, MIAT, that confers risk of myocardial infarction. Journal of human genetics 2006;51:1087-99.

    [15] Kumarswamy R, Bauters C, Volkmann I, Maury F, Fetisch J, Holzmann A, et al. Circulating long noncoding RNA, LIPCAR, predicts survival in patients with heart failure. Circulation research 2014;114:1569-75.

    [16] Arisi I, D'Onofrio M, Brandi R, Felsani A, Capsoni S, Drovandi G, et al. Gene expression biomarkers in the brain of a mouse model for Alzheimer's disease: mining of microarray data by logic classification and feature selection. Journal of Alzheimer's disease : JAD 2011;24:721-38.

    [17] Kraus TF, Haider M, Spanner J, Steinmaurer M, Dietinger V, Kretzschmar HA. Altered Long Noncoding RNA Expression Precedes the Course of Parkinson's Disease-a Preliminary Report. Molecular neurobiology 2016.

    [18] Xie H, Ma H, Zhou D. Plasma HULC as a promising novel biomarker for the detection of hepatocellular carcinoma. BioMed research international 2013;2013:136106.

    [19] Hu X, Feng Y, Zhang D, Zhao SD, Hu Z, Greshock J, et al. A functional genomic approach identifies FAL1 as an oncogenic long noncoding RNA that associates with BMI1 and represses p21 expression in cancer. Cancer cell 2014;26:344-57.

    [20] McCleland ML, Mesh K, Lorenzana E, Chopra VS, Segal E, Watanabe C, et al. CCAT1 is an enhancer-templated RNA that predicts BET sensitivity in colorectal cancer. The Journal of clinical investigation 2016;126:639-52.

     


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