門靜脈高壓癥的主要病因，可分為肝內型和肝外型兩種。
1.肝內型
按病理形態的不同又可分為竇前阻塞和竇后阻塞兩種。竇前阻塞常見的原因是血吸蟲病性肝硬化。竇后性阻塞的常見病因是肝炎后肝硬化。
2.肝外型
主要是肝外門靜脈主干血栓形成，門靜脈主要屬支的阻塞所致。
常見于以下疾病：
（1）原發性骨髓纖維化
脾腫大、肝腫大、腹水、門脈高壓、乏力等。
（2）胰腺真性囊腫
上腹不適、惡心與嘔吐、腹脹、下肢水腫等。
（3）門靜脈高壓
脾大、腹水、食管下段靜脈曲張、門脈高壓等。
（4）門脈高壓性腸病
便血、胃腸道出血、腹部不適、腹痛、門脈高壓等。
（5）藥物性肝硬化
肝大、肝腹水、門脈高壓等。
（6）特發性非硬化性門脈高壓綜合征
門脈高壓、食管下段靜脈曲張、脾大等。
（7）暴發性肝功能衰竭
低燒、乏力、食欲不振、腹水、血壓低、腦水腫、嚴重肝功能損害等。
（8）囊性纖維化
肝大、門脈高壓、阻塞性黃疸等。
（9）肝硬化
疲乏、乏力、食欲不振、門脈高壓、食欲異常等。
（10）α1-抗胰蛋白酶缺乏癥
肝昏迷、門脈高壓等。
（11）戈謝病
即葡糖腦苷脂病，是一種家族性糖脂代謝疾病，為染色體隱性遺傳。肝脾進行性大，尤以脾大更明顯，肝功能異常、生長緩慢等。
（12）小兒糖原貯積病Ⅳ型
是一類先天性酶缺陷所造成的糖原代謝障礙疾病。肝腫大、肌張力降低、脾腫大、腱反射消失、肝硬化，生長障礙等。
（13）老年人酒精性肝病
肝腫大、肝區痛、食欲不振、消瘦、惡心與嘔吐、肝功能減退、門脈高壓等。
（14）日本血吸蟲病
皮膚瘙癢、腹脹、肝脾大、疲勞、惡心與嘔吐，晚期肝硬化、門脈高壓、巨脾、腹水等。