糞便檢查：通過檢查糞便中的阿米巴滋養體和包囊來診斷阿米巴病。滋養體是活動的阿米巴，可以通過顯微鏡觀察到，而包囊是靜止的阿米巴，需要染色才能觀察到。
血清學檢查：通過檢測患者血清中的特異性抗體來診斷阿米巴病。常用的血清學檢查包括間接熒光抗體試驗（IFA）、酶聯免疫吸附試驗（ELISA）等。
組織檢查：通過活檢或手術切除組織標本來觀察組織中的阿米巴滋養體和包囊，以確定病變的性質和程度。
分子生物學檢查：通過檢測糞便或組織標本中的阿米巴DNA或RNA來診斷阿米巴病。常用的分子生物學檢查包括聚合酶鏈反應（PCR）等。