（1）根據除草劑使用方法分類。
莖葉處理劑
就是將除草劑噴灑于雜草葉片上或全株，如草甘膦、百草枯、穩殺得、拿撲凈等。這些除草劑可在非耕地也可在作物生育期使用。
土壤處理劑
這類除草劑噴施在土壤表面，封閉土壤，形成藥液層，當萌發的種子、幼苗、幼根接觸或吸收除草劑而被抑制或被殺死，如氟樂靈、拉索、乙草胺等。
莖葉兼土壤處理劑
此類除草劑既可作土壤處理劑也可作莖葉處理劑，如除草醚、莠去津、利谷隆等。
（2）根據除草劑作用方式分類。
觸殺性除草劑
這類除草劑只有局部的殺傷作用，植物接觸部分受害，未接觸部分不受影響，藥劑不能在體內傳導。如除草醚、五氯酚鈉。
內吸傳導型除草劑
這類除草劑可被植物吸收，通過根、莖、葉、芽、鞘等部位吸收后在體內傳導，除草劑經根、芽等吸收，沿蒸騰流向地上部分傳導，有的除草劑被莖葉吸收后沿篩管與光合作用產物一起向地下部分傳導，如三氮苯類、取代脲類除草劑。
（3）根據除草劑用途分類。
選擇性除草劑
這類除草劑在一定的條件和用量下，對雜草和作物間有不同的選擇性，即保護作物消滅雜草，多數有機除草劑都具有選擇性，如地樂胺、除草通、杜耳等。
滅生性除草劑
這類除草劑對雜草和作物無選擇性，既能殺死雜草又能傷害作物，無機除草劑多數屬于滅生性除草劑。
選擇性和非選擇性是相對的，不是絕對的，在一定條件下可以變化。如增加用藥量或改變使用方法，選擇性可變成滅生性。
（4）根據除草劑來源分類。
無機除草劑
主要來源于天然礦物，如亞砷酸鈉、礦油乳劑。此類除草劑用量大，選擇性差，目前很少使用。
人工合成有機除草劑
這類除草劑是目前種類最多，使用量最大，應用范圍最廣，是除草效果最好，發展較快的一類除草劑。
微生物除草劑
這是一類利用微生物活體或代謝產物制成的除草劑，如魯保1號等。
植物質類除草劑
這類除草劑是利用植物體浸出液或代謝產物，防除或抑制其他雜草生長，有的稱異株克生物質，如肉桂酸衍生物香豆素、酚酸等。
（5）按化學結構分類。
按化學結構分類主要指有機合成除草劑，具不完全統計有近20類，指酰胺類、苯胺類、取代脲類、苯氧類、苯甲酸類、氨基甲酸酯類、二苯醚類、三氮苯類、有機磷類、雜環類等。