1.慎用抗生素和皮質激素：長期大量應用廣譜抗生素可引起菌群失調，長期大量應用皮質激素可抑制機體免疫功能，均可增加隱球菌感染與播散的機會。
2.及早發現、及早治療：注意易于繼發隱球菌感染的疾病，如艾滋病、惡性腫瘤、慢性消耗性疾病、結締組織病及器官移植等。對于這類病人，應高度警惕隱球菌感染發生的可能性。對高度懷疑本病而無確切證據之前，即可應用抗真菌劑預防治療。
3.注意衛生防病：預防本菌感染，應加強對鳥鴿糞等的管理，避免接觸到被污染的土壤，防止鴿糞污染空氣，忌食腐爛變質的梨、桃等水果。
