1、兩性霉素B：兩性霉素B對新生隱球菌的抑菌濃度為0.01～1.56 μg/mL，是治療隱腦的首選藥物之一。隱球菌腦膜炎的治愈率為56.6%～81%，但治愈停藥后有1/3病例可能復發，需要進行維持治療。
⑴ 兩性霉素B的應用方法：靜脈滴注從小劑量開始，首次1～5 mg，以后每天增加5 mg（兒童1～2 mg），直至每天0.5～0.75 mg/kg體重。療程根據腦脊液轉陰時間及全身情況確定，一般應用2～3個月，腦脊液轉陰后尚需以氟康唑或伊曲康唑等維持治療3～4個月。
⑵ 毒副作用：常見寒戰、發熱、肝、腎、心肌、造血系統損害、低血鉀、房性陣發性心動過速，亦有發生心室纖顫死亡的報道。應用兩性霉素B靜脈滴注時應注意以下幾點：
①輸液速度宜慢，控制在20～30 dr/min；
②輸液瓶以黑布包裹，以防光線照射破壞兩性霉素B；
③兩性霉素B先用注射用水稀釋為5 mg/mL，再用5%葡萄糖溶液500mL稀釋，不宜用生理鹽水稀釋，以免產生沉淀；
④藥液中可同時加入地塞米松2～5 mg或氫化可的松50 mg輸注。
⑤輸液前肌注異丙嗪25 mg。
⑥如使用期間出現嚴重反應，可暫時停藥并對癥處理。
兩性霉素B鞘內注射可使腦脊液中直接達到較高的抑菌濃度，對重癥病例尤為適用。應用時一般以0.1～1 mg與地塞米松1～2 mg及適量腦脊液混勻后緩慢注入，每周1～3次。鞘內注射兩性霉素B可能出現化學性腦膜炎、頭痛加劇、腿痛、大小便困難、蛛網膜黏連、休克等較嚴重的不良反應。
2、兩性霉素B脂質體（liposome encapsulated amphotericin B）：它是一種雙層脂質體內含有兩性霉素B的新型劑制，兩性霉素B脂質體降低與機體膽固醇的結合而增強對麥角醇的結合，從而降低兩性霉素B的毒副作用，據統計，兩性霉素B脂質體的毒性約為兩性霉素B的1/70。毒性降低主要原因是：兩性霉素B摻入脂質體后其凝聚狀態發生改變，成為完全單一的單體所致。兩性霉素B脂質體中，呈單體的兩性霉素B緩慢釋放進入體內，少量釋放的兩性霉素B不足以損傷宿主細胞膜，卻集中于感染灶內殺死真菌，達到降低毒性的作用。
應用注意事項：
①先用注射用水振蕩稀釋，使兩性霉素B脂質體全部成為分散相，濃度為4 mg/mL；
②將稀釋的兩性霉素B脂質體加入5%的葡萄糖液進一步稀釋至0.2～2 mg/mL后，使用輸血過濾器避光靜脈滴注，6 h內滴注完畢，用量可從0.3 mg/kg開始，逐漸增量至1～2 mg·kg-1·d-1，對隱球菌腦膜炎總量可達5～8 g，8～12周為一療。
3、 5-氟胞嘧啶（5-FC）：5-FC對隱球菌的最低抑菌濃度為0.09～7.8 mg/mL，但單用5-FC可很快產生耐藥性，因此，多與兩性霉素B等聯合應用，兩性霉素B作用于真菌細胞膜，使其通透性發生改變，導致菌體破壞，并使5-FC易于進入真菌細胞膜起作用，因此，聯合應用有協同作用。常用劑量為50～150 mg·kg-1·d-1，分3～4次口服，亦可用1%的5-FC注射液靜脈輸入。不良反應主要有惡心、嘔吐、皮疹、寒戰、肝、腎、造血系統損害，尤其肝損害者慎用。
4、氟康唑：氟康唑為一種廣譜三唑類新型抗真菌劑，相對分子質量為306.3，具有水溶性特征，口服吸收完全，能很好地通過血腦屏障進入腦脊液，腦脊液中氟康唑藥物濃度可達到血漿藥物濃度的90%～100%，半衰期為36 h，80%的氟康唑經腎臟以原型排出，毒副作用，對新生隱球菌的最低抑菌濃度為3.12～6.25 mg/mL。一般首次靜脈滴注400 mg，以后可改為200～400 mg/d靜脈滴注，直至腦脊液新生隱球菌轉陰后改為50～150 mg/d口服，維持3～4個月。初期階段與兩性霉素B聯合應用能更快使腦脊液轉陰，并減少兩性霉素B的用量和毒副作用。毒副作用：不良反應較輕，少數患者可出現惡心、皮疹、肝酶升高、血鉀降低，也有發生Stevens-Johson綜合征的報道。
5、伊曲康唑：伊曲康唑是一種廣譜三唑類抗真菌劑，口服受胃腸道因素影響較大，不易通過血腦屏障進入腦脊液，但在腦組織中有較高的濃度，對隱球菌的最低抑菌濃度為0.01～12.5 mg/mL。我們主張與兩性霉素B合用或作為腦脊液轉陰后的維持治療，口服劑量為200～400 mg/d。毒副作用：少數患者出現惡心、嘔吐、皮疹、肝酶升高，但一般不影響治療。
抗真菌治療目前主張分期聯合治療。即分初期治療與維持治療二個階段，聯合使用抗真菌劑，這樣有利于治療轉歸的判斷及調整抗真菌劑的種類和用量。初期治療一般持續8～12周，應用兩性霉素B與5-FC或三唑類抗真菌劑合用，以盡快使腦脊液新生隱球菌轉陰，腦脊液新生隱球菌轉陰后，口服三唑類抗真菌劑維持治療3～4個月，以防復發。