從遺傳物質分類：DNA病毒、RNA病毒、類病毒、蛋白質病毒（如：朊病毒）。
從寄主類型分類：噬菌體（細菌病毒）、植物病毒（如煙草花葉病毒）、動物病毒（如禽流感病毒、天花病毒、HIV等）。
從性質來分：溫和病毒（如HIV）、烈性病毒（如狂犬病毒）。
