1、病源
革蘭氏陰性菌的病原能力通常與其細胞壁組成相關，具體說來有脂多糖（lipopolysaccharide，又稱為LPS或者內毒素（endotoxin））層。在人體中，LPS可以激發一種固有免疫反應（innate immune response）這種反應是通過細胞素制造和免疫系統活化等來描述其特征的。比如，紅腫就是細胞素產生并釋放導致的。因為脂多糖在革蘭氏陰性菌的細胞墻表皮，所以大多數或舊型抗生素都不能有效抑制此類細菌。
2、辨別方式
用結晶紫液加碘液染色，再用95%酒精脫色，然后用稀復紅液染色。經過這樣的處理，有的細菌被染成紫色，是革蘭氏陽性菌，有的被染成紅色，是革蘭氏陰性菌。