種子在進入種子凈度臺分析之前，使用風選凈度儀對其進行風選也是十分重要的，主要的作用就是通過風選凈度儀的風選，將差異明顯種子、雜質等分離開來，為進一步開展種子凈度分析提供材料。
種子凈度分析工作相對來說是非常細致的，需要進行仔細的觀察，但是如果其中混有的雜質較為明顯又比較多，而沒有有效分離的話，那么無疑會影響種子凈度分析的效率，因此在此之前就需要利用風選凈度儀將差異比較明顯的種子與雜質分離開來，下一步種子樣品進入種子凈度臺上更為仔細的分析做準備。
既然已經說了風選凈度儀分離的是差異較為明顯的種子和雜質，因此在風選凈度儀的工作原理就是根據找到的特征來進行分離，通過分析發現，這些種子和雜質之間最大的差異就是重量不一，因此根據這個特性，通過調節風選凈度儀風力的大小，正好可以有效將它們分開，并通過不同的存儲裝置，就可以實現種子和雜質的初步分離。
由此我們可以看出，風選凈度儀實際上就是一種種子清選加工設備，主要用于實驗室對各類種子進行風選試驗研究或種子加工企業對小批量蔬菜、牧草、花卉等高附加值種子進行重力分選加工。而從其應用的效果來看，經過風選凈度儀的初步分離之后，下一步的種子凈度分析工作變得更加輕松了，效率也更高，種子的凈度得到了明顯的提升，因此也證明了風選凈度儀的風選分離效果是可靠的，能為進一步開展種子凈度分析提供合格的分析材料。