(五)菌落計數：
1. 從溫箱內取出平皿進行菌落計數時，應先分別觀察同一稀釋度的兩個平皿和不同稀釋度的幾個平皿內平板上菌落生長情況。平行試驗的2個平板與菌落數應該接近，不同稀釋度的幾個平板上菌落數則應與檢樣稀釋倍數成反比，即檢樣稀釋倍數越大，菌落數越低，稀釋倍數越小，菌落數越高。
2. 計數菌落時，應選取菌落數在30~300之間的平板作為菌落總數測定的標準。1個稀釋度使用兩個平板，應采用兩個平板平均數；如其中一個平板有較大片狀菌落生長時，則不宜采用，而應以無片狀菌落生長的平板作為該稀釋度的菌落數，若片狀菌落不到平板的一半，而其余一半中菌落分布又很均勻，即可計算半個平板后乘2以代表全皿菌落數。如在一個稀釋度的兩個平板中，一個平板的菌落數在30～300之間，另一個大于300或小于30時，則以菌落數在30～300間的平板作為計數的標準。
3. 注意事項
(1)如果稀釋度大的平板上菌落數反比稀釋度小的平板上菌落數高，則系檢驗工作中發生的差錯，屬實驗室事故。此外，也可能因抑菌劑混入樣品中所致，均不可用作檢樣計數報告的依據。
(2)如果平板上出現鏈狀菌落，菌落之間沒有明顯的界限，這是在瓊脂與檢樣混合時，一個細菌塊被分散所造成。一條鏈作為一個菌落計，如有來源不同的幾條鏈，每條鏈作為一個菌落計，不要把鏈上生長的各個菌落分開來數。此外，如皿內瓊脂凝固后未及時進行培養而遭受昆蟲侵入，在昆蟲爬過的地方也會出現鏈狀菌落，也不應分開來數。
(3)如果所有平板上都有菌落密布，不要用多不可計作報告，而應在稀釋度最大的平板上，任意數其中2cm2個，除2求出每cm2內平均菌落數乘以皿底面積63.6cm2數，再乘其稀釋倍數作報告。例如10-1～10-3稀釋度的所有平板上均菌落密布，而在lO-3稀釋的平板上任數2個cm2。內的菌落數是60個，皿底直徑為9cm，則該檢樣每g(或m1)中“估計”菌落數為：60／2×63．6×1000=1908000或1.9×106。
63.6cm2數系按皿底直徑為9cm時計算而得，即：(9／2)2×3．14=63．6；如所用平皿的皿底直徑不是9cm，則可按其直徑的實際cm數代人圓面積公式求出。
(4)菌落計數中，如能使用國產JLQ-S。型菌落計數器，則比較方便，燈光由側面射向平板，菌落易于觀察。由于儀器帶有電子音響訊號，用特制金屬探筆點數中，在發出音響之下始顯示數字增加，不會發生差錯。且燈光與平板之間夾有多用方格玻質規板(方格面積為lcm2)，也有助于對菌落密布的平板進行計數。
(5)檢樣如系微生物類制劑(如酸牛乳、酵母制酸性飲料)，則平板計數中應相應地將有關微生物(乳酸桿菌、酵母菌)排除，不可并入檢樣的菌落總數內作報告。一般在校正檢樣的pH7．6后，再進行稀釋和培養，此類嗜酸性微生物往往即不易生長。并可用革蘭氏法染色鑒別。染色鑒別時，要用不校正pH的檢樣做成相同稀釋度的稀釋液培養所生成的菌落涂片染色作對照，以資辨別。酵母菌卵圓形，遠比細菌大，大小為2～5×5～30μm，革蘭氏陽性著色。乳酸桿菌在24小時內，于普通營養瓊脂平板上在有氧條件下培養，通常是不生長的。
(六)報告方式
1. 菌落數小于100CFU 時,按“四舍五入”原則修約,以整數報告。菌落數大于或等于100CFU 時,第3位數字采用“四舍五入”原則修約后,取前2位數字,后面用0代替位數;也可用10的指數形式來表示,按“四舍五入”原則修約后,采用兩位有效數字。若所有平板上為蔓延菌落而無法計數,則報告菌落蔓延。若空白對照上有菌落生長,則此次檢測結果無效。
2. 檢樣為固體，用重量法取樣檢驗時，以g為單位報告其菌落數；檢樣為液體，用容量法取樣檢驗時，以mL為單位報告其菌落數；如檢樣為樣品表面的涂擦液，則應以cm2為單位報告其菌落數。
3. 如檢樣為液體，在兩個平皿內所加lmL未經稀釋的檢樣(原液)培養中，均無細菌集落生成，則報告為lmL檢樣內未有菌落生長，或1mL檢樣內菌落數<1。
四、菌落總數測定的特殊方法
(一)平板表面涂布法
將營養瓊脂培養基制成平板，經50℃，l－2小時或35℃，18－20小時干燥后，于其上滴加檢樣稀釋液0.2mL，用L捧涂布于整個平板的表面，放置片刻(約10分鐘)，將平板翻轉，移至36±1℃溫箱內培養24±2小時(水產品用30℃培養48±2小時)，取出，按前述方式進行菌落計數，然后乘以5(由0.2mL換算為1mL)，再乘以樣品稀釋的倍數，即得每g或mL檢樣所含菌落數。
此法較上述傾注法為優，因菌落生長在表面，便于識別和檢查其形態，雖檢樣中帶有食品顆粒也不會發生混淆，同時還可使細菌不必遭受融化瓊脂的熱力，不致因此而使菌細胞受到損傷而不生長，從而可避免由于檢驗操作中的不良因素而使檢樣中細菌菌落數降低。但是本法取樣量較傾注法為少(僅傾注法的五分之一)，代表性將受到一定的影響。
(二)平板表面點滴法
與涂布法相似，所不同者，只是用標定好的微量吸管或注射器針頭按滴（使每滴相當于0.025mi）將檢樣稀釋液滴加于瓊脂平板上固定的區域（預先在平板背面用標記筆劃成四個區域），每個區域滴1滴，每個稀釋度滴兩個區域，作為平行試驗。滴加后，將平板放平片刻（約5～10分鐘），然后翻轉平板，如前移入溫箱內培養6～8小時后進行計數，將所得菌落數乘以40（由0.025mL換算為1mL），再乘以樣品稀釋的倍數，即得每g或mL檢樣所含菌落數。