1、金絲馬尾連根及根莖含小檗流（berberine），小檗胺（berbamine），原阿片堿（protopine），鶴氏唐松草堿hernandezine），木蘭花堿（magnoflorine），藥根堿（jatrorrhizine），掌葉防己堿（palmatine），黃連堿（coptisine），非洲防已堿（columbamine），芬氏唐松草定堿（thalifendine），四去氫碎葉紫堇堿（groenlandicine，tetradehydrocheilanthifoline），芬氏唐松草堿（thalidezine），異芬氏唐松草堿（isothalidezine），隱品堿（cryptopine），伊米任堿（izmirine），O-甲基羅氏唐松草堿（O-methylthalibrine）。
2、昭通唐松草根含小檗堿（berberine），并可能含木蘭花減（magnoflorine），藥根堿（jatrorrhizine），掌葉防己堿（palmatine），小檗胺（berbamine），原阿片堿（protopine）。
3、高原唐松草全草含唐松明堿（thalmine），2-去甲唐松明堿（2-northalmine），O-甲基唐松明堿（O-methylthalmine），厚果唐松草次堿（thalidasine），2-去甲厚果唐松草次堿（2-northalidasine），皺唐松草醛酮堿（thalrugosinone），鐵線蕨葉堿（adiantifoline），唐松草布拉明堿（thalibulamine），大葉唐松草堿（thalifaberine），大葉唐松草亭堿（thalifaretine），大葉唐松草尼星堿（thalifaricine），大葉唐松草嗪堿（thalifarazine），大葉唐松草明堿（thalifaramine），大葉唐松草靈堿（thalifaroline），去羥大葉唐松草靈堿（thalifaronine），外卷唐松草亭堿（thalilutine），唐松明靈堿（thalmineline），秋唐松草替定堿（thalmelatidine），箭頭唐松草米定堿（thalicsimidine），小檗堿（berberine），高原唐松草堿（thalcultrimine），O-甲基唐松草檗堿（O-methylthalicberine），5-羥基厚果唐松草次堿（5-hydroxythalidasine），唐松草菲靈（thaliphylline），高原唐松草靈堿（thalmiculine），高原唐松草明堿（thalmiculimine），5-羥基唐松明堿（5-hydroxythalmine），唐松草舒平堿（thalisopine，thaligosine），皺唐松草寧堿（thalrugosaminine），網葉番荔枝堿（reticuline），高原唐松草替明堿（thalmiculatimine），小唐松草瓦星堿（thalsivasine），唐松草亭堿（thalictine），皺唐松草定堿（thalrugosidine）2'-去甲唐松草菲靈（2'-northaliphylline），2'-去甲尖刺堿（2'-noroxyacanthine），高原唐松草米寧堿（cultithalminine），新羅氏唐松草堿-2'-α-N-氧化物（neothalibrine-2'-α-N-oxide），皺唐松草寧堿-2-α-N-氧化物（thalrugosaminine-2-α-N-oxide），唐松草舒平堿-2-α-N-氧化物（thaligosine-2-α-N-oxide），唐松草菲靈-2'-β-N-氧化物（thaliphylline-'β-N-oxide），厚果唐松草次堿-2-α-N-氧化物（thalidasine-2-α-N-oxide），5-羥基厚果唐松草次堿-2-α-N-氧化物（5-hydroxythalidasine-2-α-N-oxide），掌葉防已堿（palmatine），藥根堿（jatrorrhizine），非洲防己堿（columbamine），芬氏唐松草定堿（thalifendine），木蘭花堿（magnofloine），芬氏唐松草亭堿（tbalidastine）等。
4、多葉唐松草根莖含小檗堿（berberine），掌葉防己堿（palmatine），藥根堿（jatrorrhizine），鶴氏唐松草堿（hernandezine），木蘭花堿（magnoflorine），皺唐松草定堿（thalrugosidine），厚果唐松草堿（thalicarpine），厚果唐松草次堿（thalidasine），N，O，O-三甲基散花巴豆堿（N，O，O-trimethylsparsiflorine），網葉番荔枝堿（reticuline）。根含小檗堿，藥根堿，掌葉防已堿，木蘭花堿，芬氏唐松草定堿（thalifendine），非洲防已堿（columbamine），芬氏唐松草亭堿（thalidastine），去氫分離木瓣樹胺（dehydrodiscretamine），皺唐松草酮堿，N-甲基網葉番荔枝堿（tembetarine），竹葉椒堿（xanthoplanine），皺唐松草定堿（thalrugosidine），皺唐松草寧堿（thalrugosaminine），唐松草舒平堿（thalisopine，thaligosine），皺唐松草吉定堿（thalirugidine），氧化小檗堿（oxyberberine），去甲氧化白毛茛分堿（noroxyhydrastinine）。
5、貝加爾唐松草根莖含貝加爾定（baicalidine），海罌粟堿（glaucine），小檗堿（berberine），貝加爾靈（baicaline），木蘭花堿（magnoflorine），貝加爾唐松定堿（thalbaicalidine），貝加爾唐松靈堿（thalbaicaline）。莖含小檗堿，海罌粟堿，貝加爾靈，貝加爾唐松靈堿，7-氧代貝加爾靈（7-oxobaicaline），5-O-去申柱唐松草堿（5-O-demethylthalistyline），N-去甲柱唐松草堿（N-demethylthalistyline），β-谷甾醇（β-sitosterol）。
6、黃唐松草根含小檗堿（berberine，thalsine），木蘭花堿（magnoflorine），隱品堿（cryptopine），唐松星堿（thalixine，thalicsine）。地上部分主含小檗堿，還含黃唐松草堿（thalflavine），厚果唐松草堿（thalicarpine），厚果唐松草次堿（thalidasine），唐松草檗堿甲醚（O-methylthalicberine），香唐松草堿（thalfoetidine），鶴氏唐松草堿（hernandezine），唐松草酸（thalictricacid）。種子含油，其中脂肪酸為：棕櫚酸（palmiticacid），硬脂酸（stearicacid），花生酸（arachidicacid），山萮酸（behenicacid），蠟酸（ceroticacid），油酸（oleicacid），亞油酸（linoeicacid），異亞油酸（isolinoleicacid），十八碳三烯酸（octadecatrienoicacid），二十四烷酸（lignocericacid）等。