⒈多次抽吸取材失敗；
⒉為正確判定血細胞減少癥患者骨髓增生程度及其病因；
⒊可疑罹患骨髓纖維化、真性紅細胞增多癥、原發性血小板增多癥、骨髓增生異常綜合癥、惡性淋巴瘤、多發性骨髓瘤、淀粉樣變性、肉芽腫病、轉移瘤和再生障礙性貧血的患者；
⒋骨髓活檢對急性粒細胞白血病的診斷以及化療是否達到真正完全緩解的判斷有意義。凡涂片已達完全緩解，但一步法雙標本取材之活檢切片內仍可檢出白血性原始細胞簇，就應繼續給予鞏固化療，只至切片內此種異常定位的白血性原始細胞簇消失為止；
⒌在急性粒細胞白血病的緩解后化療及長期無病生存期間，應定期作骨髓一步法雙標本取材，倘若涂片細胞計數未達復發標準，而切片內出現了異常原始細胞簇，提示已進入早期復發，應及時作在誘導處理；
⒍慢性粒細胞白血病慢性期應常規作骨髓活檢，以測定患者屬何種組織學亞型；
⒎未正確判斷骨髓鐵貯存，尤其疑為貯鐵降低或缺鐵時，在骨髓活檢切片上作鐵染色較涂片為優；
⒏對骨病本身和某些骨髓疾患，例如囊狀纖維性骨炎、骨纖維發育異常癥、變應性骨炎（Paget病）、骨軟化癥、骨髓疏松癥和骨髓腔真菌感染等的診斷，骨髓活檢也能提供有意義的資料。