現在一般都認為初級溶酶體的形成過程與分泌顆粒的形成類似，也起自高爾基體囊泡。初級溶酶體與分泌顆粒（主要指一些酶原顆粒），從本質上看具有同一性,因為溶酶體含多種酶（主要是各種水解酶），是蛋白質與酶原顆粒一樣，也參與分解代謝物的作用。不同處在于：酶原顆粒是排出細胞外發揮作用，而溶酶體內的酶類主要在細胞內起作用。
