急性高碳酸血癥可降低骨骼肌的收縮力(尤其是膈肌),進一步的效應是降低耐力。慢性高碳酸血癥也可顯示肌力下降,但氧分壓正常的急性PHY則報道較少,可刺激腎上腺髓質分泌腎上腺素、去甲腎上腺素,也可使ACTH、醛固酮及抗利尿激素的分泌增加。