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  • 發布時間:2020-06-23 22:15 原文鏈接: 高通量研究脊椎動物多維表型的方法(二)

     

     

    3.顱面畸形三維重建與評估:每條斑馬魚幼體,記錄高達320幀的圖像,通過三維重構技術,形象化展示了斑馬魚幼體軟骨復雜表型。圖像顯示的層析效果圖充分顯示了三種不同藥物處理后的5dpf斑馬魚幼體的顱面骨骼變化。三種藥物是:retinoic acid(視黃酸)、cyclopamine(環巴胺)和flusilazole(氟硅唑)。

     

    4.藥物篩選研究實例:不同濃度環巴胺藥物對三種軟骨生長的影響

     

     

     

    5.體內多維度表型分析:為了全面定量斑馬魚幼體表型變異情況,研究者計算了202個獨立的指標,用于重建3D表型圖。這些參數包含了長度、3D方向、表面積及各種骨骼體積等等。

     

     

     

    6.大量斑馬魚幼體表型變化陣列分布:每一行代表了一種藥物作用斑馬魚幼體的影響。檢測結果以顏色表示,紅色代表幼體個體表型相對未處理幼體表達下降,綠色代表表達增長。

     

    結論:

     

    傳統藥物高內涵篩選(HCS)技術局限在簡化的生物模型,如無線增殖的細胞系等,而在使用原代細胞、in vivo動物模型等進行HCS研究時,傳統技術面臨眾多的問題。本研究利用微米分辨率的高通量光學投影層析成像系統,結合高效的大顆粒流式分選系統(Union Biometrica),實現了脊椎動物的整體多維度掃描。本技術能夠提供脊椎動物器官和組織的3D重建圖像,針對斑馬魚幼體的研究,本技術通過能夠為研究者提供樣本個體的多種表型特征,為動物個體水平實現藥物高內涵篩選(HCS)提供了可行的技術平臺。

     

     

    相關介紹:

     

    Union Biometrica大顆粒流式分選系統:是基于流式細胞技術開發的,與普通的流式細胞技術相比有非常很重要的特點和優勢:

    這是市面上唯一的能夠分選1-1500um生物微粒的全自動高通量分選系統。他的管路直徑大,可以用來分選體積較大的生物微粒,因此可以用來應用于小的模式生物,比如斑馬魚,線蟲、果蠅等,也可應用于大體積細胞:胚胎干細胞,胰島細胞、肝細胞,細胞簇等,還可用于藥物化合物的高通量的藥物篩選。這款儀器的技術核心,是氣流分選裝置,通過氣流就行微粒的分選,這種方式非常溫和,確保了收集到的生物活體或敏感物質的活性和完整性。

     

     

    Union Biometrica流式分選系統進行斑馬魚研究的文獻:

     

    1.Presenting VAST BioImager?: A new modular, expandable platform to automate the orientation of 2-7 day old zebrafish larvae for imaging

    2.Development and Validation of an Automated High-Throughput System for Zebrafish In Vivo Screenings

    3.Fully automated cellular-resolution vertebrate screening platform with parallel animal processing

    4.Fully automated cellular-resolution vertebrate screening platform with parallel animal processing

    5.A High-Throughput Screen for Tuberculosis Progression

    6.Zebrafish high throughput screening using robotic injection technology

    7.High-throughput in vivo vertebrate screening.

    8.Zebrafish High-Throughput Screening of Innate Immune Responses.

    9.A High-Throughput Assay To Measure Whole Body Metabolic Rate Using Zebrafish Larvae.

    10.A Whole-Animal Microplate Assay for Metabolic Rate Using Zebrafish


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