鳥槍法如何測序

全基因組鳥槍法測序（Whole Genome Shotgun Sequencing）無需構建各類復雜的物理圖譜和遺傳圖譜，采用最經濟有效基因組鳥槍法測序/鳥槍法Shotgun測序（Whole Genome Shotgun Sequencing）無需構建各類復雜的物理圖譜和遺傳圖譜，采用最經濟有效的實驗設計方案，直接將整個基因組打成不同大小的DNA片段構建Shotgun文庫，對文庫進行隨機測序，最后運用生物信息學方法將測序片段拼接成全基因組序列。
全基因組鳥槍法測序的主要步驟是：第一，建立高度隨機、插入片段大小為1.6kb到4kb左右的基因組文庫。克隆數要達到一定數量，即經過兩端測序的克隆片段的堿基總數應達到基因組大小的6到10倍。第二，高效、大規模的克隆雙向測序。第三，序列組裝。借助Phred, Phrap, Consed 軟件進行序列組裝，產生一定數量的contig。第四，填補缺口。有兩種待填補的缺口，一是沒有相應模板DNA的物理缺口，我們通過PCR的方法進行填補；二是有模板DNA但未測到的序列缺口，我們直接在模板DNA上設計引物測序。

鳥槍法測序適用范圍：BAC、Fosmid、cosmid、線粒體DNA、葉綠體DNA等。

全基因組鳥槍法測序的主要步驟是：第一，建立高度隨機、插入片段大小為1.6kb到4kb左右的基因組文庫。克隆數要達到一定數量，即經過兩端測序的克隆片段的堿基總數應達到基因組大小的6到10倍。第二，高效、大規模的克隆雙向測序。第三，序列組裝。借助Phred, Phrap, Consed 軟件進行序列組裝，產生一定數量的contig。第四，填補缺口。有兩種待填補的缺口，一是沒有相應模板DNA的物理缺口，通過PCR的方法進行填補；二是有模板DNA但未測到的序列缺口，直接在模板DNA上設計引物測序。