小檗堿有利膽作用，增加膽汁形成，使膽汁變稀，對慢性膽囊炎患者，口服有良好效果。在慢性試驗中，小檗堿對大鼠口服（20毫克/公斤）、肌肉注射（2毫克/公斤）可降低血清膽甾醇。黃連的熱水浸液對家兔在飼喂膽甾醇或切除甲狀腺后，可使升高的血清C/P值較早的恢復正常或降低血脂質水平。對家兔的苯肼性動脈硬化癥，三黃粉（黃連、黃芩、大黃）可使升高的c/P值有所下降。早年報告的降低血糖的作用，未被證實。據報道，小檗堿及某些苦味健胃藥（丁香中的石竹萜烯等）有抗貧血作用。對注射苯肼及二胺甲苯引起貧血的家兔，小檗堿可使紅細胞的減少幅度較對照組少而血紅蛋白也有某些增高。但也有報告，未發現黃連粉末有此作用。早年報告的小檗堿能減少白細胞，抑制白細胞的阿米巴樣運動，未被證實，一般劑量時，它對白細胞并無影響。