混于塵埃中的衣原體或感染性氣溶膠可經由呼吸道引起吸入性感染;而接觸帶菌鳥及其污染的分泌、排泄物等,則可經有破損皮膚或黏膜以及消化道等多種途徑獲得感染。
患者痰中可長期帶衣原體,亦可造成他人被感染。本病在鳥類之間,也時有傳播,以通過攜帶衣原體鳥屎所污染的食料與空氣為主。