誘導位點
誘導部位為首次接觸抗原并誘導起始反應的部位，主要有一些粘膜相關的淋巴組織，包括腸道相關淋巴組織、支氣管相關淋巴組織和近幾年發現的眼結膜相關淋巴組織或微褶細胞(M細胞)等具有生發中心的上皮淋巴組織。當病原體與之接觸，即被攝取，誘導T細胞和B細胞反應。在IgA的誘導位點可以出現所有的免疫活性細胞,如CD4+、Th細胞、CD8+、CTLs、B細胞和輔助細胞。這些細胞調節抗原特異性效應細胞的產生，參與粘膜表面的體液免疫和細胞免疫。
效應位點
局部粘膜免疫的效應部位包括腸道、呼吸道、生殖道等粘膜的固有層及一些腺體如乳腺和淚腺等。已知人類淚腺中85%的抗體為sIgA。禽類特有的哈德氏腺是一個局部免疫器官。腸道粘膜固有層是最大的粘膜效應位點, ，可分離到大量的IgA型漿細胞。其主要細胞成分為淋巴細胞，其中B細胞占20%～40%，T細胞占40%～60%，巨噬細胞占10%,嗜酸性粒細胞占5%，T細胞大部分為CD3+、CD4+、CD8-，起促進免疫的功能。約1/3的T細胞是CD3+、CD4-、CD8+，起細胞毒性作用。
在抗原刺激IgA誘導部位之后，粘膜結合淋巴組織內的B細胞和T細胞被致敏，致敏的T細胞和B細胞通過淋巴管離開粘膜結合淋巴組織，并通過胸導管進入血液循環，之后進入效應部位。在這里B細胞定居下來，并在抗原、T細胞及細胞因子的刺激下增殖變成成熟的IgA漿細胞，并分泌IgA。