鼠斑疹傷寒的病原體為莫氏立克次體，其形態、染色特點、生化反應、培養條件及抵抗力等均與普氏立克次體相似，但很少呈長鏈排列。而在實驗動物病損以及抗原性方面有所不同。兩者各含3/4種特異性顆粒性抗原，和1/4組特異性可溶性抗原；后者耐熱，為兩者所共有，故可產生交叉反應。不耐熱的顆粒性抗原則各具特異性，可藉補結試驗而相互區別。莫氏立克次體所致的豚鼠陰囊反應遠較普氏立克次體所致者為明顯，對小鼠和大鼠的致病性也較強。病原體接種于小鼠腹腔后可引起腹膜炎、立克次體血癥，并在各臟器內查見病原體。
1.莫氏立克次體感染雄性豚鼠后，豚鼠除發熱外陰囊高度腫脹，睪丸明顯腫大，由于莫氏立克次體在睪丸鞘膜的漿膜細胞中快速繁殖，故在鞘膜滲出液涂片中可查見大量立克次體，稱豚鼠陰囊現象；而普氏立克次體僅引起輕度的陰囊反應。
2.莫氏立克次體感染大白鼠可使其發熱或致死，亦可在其腦內存活數月，故可用以保菌及傳代；而普氏立克次體僅使大白鼠形成隱性感染。
3.用本病原體對小白鼠進行腹腔接種可引起致死性腹膜炎；而普氏立克次體則不能。
4.莫氏立克次體與普氏立克次體有共同的具有組特異性的耐熱性可溶性抗原，故二者可有交叉免疫反應。各自又有不同的顆粒抗原，可借以通過凝集試驗、補體結合試驗及免疫熒光試驗等與流行性斑疹傷寒相鑒別。莫氏立克次體寄生于鼠蚤腸壁細胞內，不影響鼠蚤生命；而普氏立克次體可使被感染的虱致死。