出血風險：鼻甲消融術是一種創傷非常小的手術，但仍然有出血的可能。少量出血通常表現為鼻涕里帶少量血絲，可以自行停止。如果凝血功能不佳，如長期服用抗凝藥物，或手術時正處于炎癥急性期（如感冒），出血可能會多一些且不易止住。在這種情況下，可能需要進行鼻腔填塞壓迫止血。
術后鼻腔干燥：如果平時使用鼻腔減充血劑太多、太頻繁，或鼻甲消融術時消融的程度過重，術后可能會出現鼻腔干燥的情況。因此，在術后應該在醫生的指導下適量使用鼻腔減充血劑，并注意保持鼻腔濕潤。
術后鼻腔粘連：術后傷口愈合期間有可能會出現傷口與附近的鼻腔黏膜長到一起、粘住了的情況。因此，術后需要定期復查，及早發現粘連并進行粘連松解手術。
原有鼻塞癥狀改善不滿意：鼻塞可能不僅僅是鼻甲肥大引起的，還有很多其他原因，比如鼻炎、鼻息肉、鼻竇炎等。因此，對鼻甲消融手術要有合理的期望值。雖然大部分人術后可以感覺鼻塞明顯緩解，但也有部分病人感覺鼻塞沒什么太大的變化。這就需要去尋找其他的病因，并進行針對性的治療。