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  • 發布時間:2014-12-02 11:12 原文鏈接: 盧煜明:血漿DNA測序技術檢測紅斑狼瘡

      來自香港中文大學的研究人員采用基因組和甲基化組測序方法,揭示出了系統性紅斑狼瘡(SLE)患者血漿DNA的異常。研究結果發布在11月26日的《美國國家科學院院刊》(PNAS)上。

      領導這一研究的是香港中文大學的盧煜明(Y. M. Dennis Lo)教授。盧煜明教授是分子生物學的臨床應用專家,尤其致力于人體內血漿DNA和RNA的研究。盧教授早在1997年就發現了孕婦外周血中存在漂流的胎兒DNA,并發展出了一套新技術來準確分析和度量母親血漿內的胎兒DNA,被譽為無創產前診斷的奠基人,2013年入選美國科學院外籍院士。

      系統性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)是一種彌漫性、全身性自身免疫病,主要累及皮膚粘膜、骨骼肌肉、腎臟及中樞神經系統,同時還可以累及肺、心臟、血液等多個器官和系統,表現出多種臨床表現;血清中可檢測到多種自身抗體和免疫學異常。雖然隨著臨床診治水平的提高,紅斑狼瘡患者病死率已有下降,但它仍是最主要的致殘、致死性自體免疫性疾病。該疾病的病因至今尚不明確,大量研究顯示遺傳、感染、內分泌、免疫異常和一些環境因素與發病有關。近年來測序技術飛速發展為鑒別出紅斑狼瘡的病因以及實現個體化治療帶來了希望。

      在這篇文章中,研究人員報告稱他們采用大規模平行基因組和甲基化組測序,對系統性紅斑狼瘡患者血漿DNA的生物學特征進行了高分辨分析,由此發現了大量的血漿DNA異常。首先,他們鑒別出了系統性紅斑狼瘡患者血漿中的一些檢測基因組代表(measured genomic representations ,MGRs)異常。證實MGRs異常的程度與抗雙鏈DNA(抗dsDNA)抗體水平相關聯。其次,他們發現活動期系統性紅斑狼瘡患者血漿DNA顯示出分子大小偏態分布,短DNA片段的比例顯著增高。且在系統性紅斑狼瘡患者中血漿DNA縮短的程度與系統性紅斑狼瘡疾病活動指數(SLEDAI)以及抗 dsDNA抗體水平相關。此外,他們還證實活動期系統性紅斑狼瘡患者的DNA甲基化密度下降。且低甲基化程度與SLEDAI和dsDNA抗體水平相關。

      為了探討抗dsDNA抗體對于系統性紅斑狼瘡中血漿DNA的影響,研究人員采用了一種基于列 (Column-Based)的G蛋白捕獲技術,來分離血漿中的IgG結合和非IgG結合DNA。研究人員發現與健康個體相比,系統性紅斑狼瘡患者血漿中 IgG結合DNA的濃度增高。較多的IgG結合發生在一些基因組位點,表明MGRs增高。此外,他們證實相比于非IgG結合血漿DNA,IgG結合血漿 DNA更短、低甲基化程度越高。

      這些觀察結果增進了我們對于系統性紅斑狼瘡中血漿DNA異常譜的理解,并有可能為我們提供了一些系統性紅斑狼瘡的新分子標記物。此外,作者們也在文章提出基于這些結果,當解讀系統性紅斑狼瘡患者的血漿DNA、非侵襲性產前檢測以及癌癥測試結果時,人們應當持謹慎小心的態度。

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