距離中國生物信息中心還有多遠

　　10月1日，由于美國民主、共和兩黨尚未解決新財年的政府預算分歧，聯邦政府的非核心部門被迫關門。其中就包括醫學、藥學及生命科學從業者及研究者依賴度甚高的NCBI(美國國立生物技術信息中心)網站。

　　NCBI 是由美國參議員Claude Pepper于上世紀80年代后期發起成立。旨在發展新的信息學技術來幫助理解那些控制健康和疾病的基本分子和遺傳過程。此外，NCBI還負責開發自動化系統用于存儲、分析關于分子生物學、生物化學、遺傳學等方面知識信息;通過研究和醫學團體所提供的軟件和數據庫使得其得以利用;收集國內外生物技術信息資源;開展基于計算機信息處理過程高級方法研究，用于分析生物大分子的結構和功能。

　　NCBI數據暫停更新，對于世界各地的研究者的影響不言而喻。世界各地的研究者不僅向NCBI提交自己的研究數據，同時還利用其旗下紛繁復雜而又功能強大的數據庫幫助推進自己的研究。這對中國研究者的影響更甚，因為中國目前并沒有自主的生物信息中心，NCBI數據暫停更新直接影響到中國研究者的工作。

　　隨著高通量技術的發展，生命科學、生物醫藥的研究已經全面進入了大數據時代，生物信息已成為破譯大數據必不可少的工具。中國沒有自己的生物信息中心，一直面臨著“出口轉內銷”的模式，科研數據不得不提交到國外數據庫，需要數據時又不得不從國外數據庫下載;網絡技術的限制與瓶頸給科研人員帶來了諸多煩惱。盡管中國是數據產出大國，每年向國外數據庫遞交了大量數據，但在他們眼中，中國一直是作為用戶在使用他們免費提供的資源，而未做出任何貢獻。這就導致中國在國際上徹底尚失了話語權并造成了負面影響。

　　慶幸的是，國內已有科研精英意識到建立生物信息數據庫的重要性，并且開始正在籌劃成立中國自主的生物信息學中心。該計劃由陳潤生等9位院士聯名向院士局提議，現有12個國內優勢的生命科學、生物醫藥、計算科學、生物信息等單位參與，其中包括北京大學生物信息學中心、中科院基因組學中心、北京蛋白質組學中心、太倉生物信息研究所等機構。項目正處于全面調研階段，預計今年年底完成調研報告的撰寫，爭取納入國家的“十三五”規劃。

　　值得一提的是，在NCBI暫停更新之后，太倉生物信息研究所憑借自身技術優勢為中國的生命科學研究發揮著積極的作用。

　　太倉生物信息研究所(TILSI)是一個學術研究機構、非盈利性的事業單位，致力于建設國內外生物數據、分析工具和科學文獻資源的整合平臺，為支持具有重大戰略意義的國家級生命科學研究做出重要貢獻，推動中國生命科學、生物醫藥以及生物信息學研究的發展。

　　目前TILSI已整合的6種數據類型——基因組、核酸、蛋白質、結構、疾病、分子間相互作用均為生命科學、生物醫藥研究領域常用的數據庫，在NCBI暫停工作期間尚無需要更新的內容。6種類型的11個數據庫中僅有Refseq參考序列數據庫的數據來源于NCBI，其他數據主要來自EBI，EBI不會因為 NCBI暫停更新而停止更新，所以TILSI的數據資源不會受到影響，用戶可放心使用。

　　另外TILSI自主研發了國內首個生命科學領域的全局搜索引擎bioso!，支持多種數據類型，方便科研工作者在海量的信息中整合出相關的數據。作為數據平臺的入口，bioso!為用戶提供了跨數據庫的 “一站式”檢索與“百科全書”式的展示。百科全書分為五個章節，已對外開放三個章節-基因與基因組，基因型與表現型，相互作用與網絡;剩余兩個章節處于準備階段。

　　早日成立中國自主的生物信息學中心，從而整合國內現有的優質資源，開發出中國特色的數據庫與服務，更好地為中國用戶提供科研支撐，并且通過加入國際聯盟，參與國際合作，才能提升中國在國際上的地位和話語權。