ORFeome：基因組規模的人類ORF資源

　　一個國際合作組織，包括Dana-Farber癌癥研究所，已經在創造人類細胞中不同蛋白質的成千上萬的完整基因圖譜庫的工作上達到了一個里程碑。開放閱讀框ORF（編碼蛋白全長的基因）的集合，是科學家研究人類細胞基礎機制和疾病中的過程的重要資源。

　　在2月25日發表在Nature Method上的文章，報導了由13個學術、商業和政府組織進行的ORFeome合作（OC）宣布現在現在他們收集的ORF克隆共計17,154個占人類細胞所有蛋白編碼基因的80%。它是世界上最大的人類基因集合并公開提供給全世界的研究團隊。

　　“OC ORF集合可以在廣泛研究領域中被充分利用。”文章的資深作者David E. Hill博士，Dana-Farber癌癥系統生物學中心的副主任說，“為了全面探索的細胞生理學，科學家需要一種資源，使他們能夠變得幾乎任何目標蛋白。OC就是能為這種工作提供獨特和有價值的工具。

　　從這個合作開始的2005年成千上萬的科學家在自己的研究中運用OC提供的ORF克隆。應用包括蛋白質相互作用的大規模圖譜繪制，重組人源蛋白的生產，特殊蛋白的功能篩選，疾病特異性蛋白相互作用網絡的開發，敲除細胞關鍵蛋白的效應的研究以及其它用途。

　　這些克隆可以從OC在世界各地的分支機構以最低的價格獲得。OC也不限制它們的使用。關于合作和克隆預定可以從OC的網站http://www.orfeomecollaboration.org/.獲得。

　　文章的第一作者，德國癌癥研究中心的Stefan Wiemann說：“這個網站有一個可檢索的數據庫。在這里我們提供克隆和編碼蛋白的注解來提高業界的利用率。”

　　每個ORF包含特定基因的蛋白編碼區。每個ORF克隆克隆到質粒里、轉入細菌凍存在OC的多個分支機構。這些克隆提供Gateway載體形式，這種形式允許很容易地轉化到各種表達蛋白的受體，比如大腸桿菌、酵母和哺乳動物細胞，甚至是無細胞表達體系。

　　OC的發展已經超出了21世紀初時人類ORFeome合作會議的討論范疇。Hill博士說：“來自各個機構的參與者開始討論他們在產生和驗證ORF的領域里做了什么。我們開始考慮我們怎樣合作盡最大可能來收集。”

　　Hill繼續介紹：“OC不同成員在合作中扮演不同角色。一些團隊已經加入新的克隆的收集，一些做DNA測序，或者集中在ORF的質量控制。有一些做信息工作，而其他人主要是參與分配。達到目前的里程碑是不同人和組織的共同努力。每個人都參與了重要的貢獻，這是個非常愉快和富有成效的合作。”

　　現在這個階段代表的是新的開始，OC的成員繼續共同努力，擴大人類ORFeome的同時也添加其他模式生物的ORFeome。