( 18 ) 當移動鼠標到兩個鏈接的蛋白點之一上時，與這個點鏈接的每個點的十字標記的顏色都變成橙色 （在另一塊膠上有一個匹配的蛋白點）。當鼠標點到這些點中的一個時，只有包括在同一個網絡中的點顯示橙色（ 圖 23-12)。你可以通過聲明一個新的關系，確認這些數據，這樣就可以擴大點的網絡。
( 19 ) 關閉 DV02121001 凝膠，再重新開啟（同時按 Alt p 鍵，或按照第 3 和第 5 步的描述操作）。
( 20 ) 在 DV02121001 凝膠中尋找 1757 號蛋白點（按照第 7 步描述操作）。
( 21 ) 同步顯示這兩個凝膠圖像（按照第 8 到 10 步中的描述操作）。
( 22 ) 確定 ident 顯示方式是被激活的（見第 5 步 ) 。凝膠信息摘要顯示在每一個凝膠窗口的右上角，報告被檢測和鑒定過的蛋白點的數目。在 DV02041611 凝膠上，用紅十字標記的點代表有 9 個點已被鑒定過。在 DV02121001 ( DLFM 02121001) 凝膠上，盡管有一個點被紅十字標記 1386 號蛋白點，但沒有蛋白點被鑒定過。這些明顯相互矛盾的數據說明了蛋白點的網絡設施：DV02121001 凝膠上的 1757 號點是被鑒定出來的 ( 因為已經用紅色十字標出），因為它與另一個已被鑒定出來的點關聯（在這個實驗中先前創建的關系）。然而，在右上角的摘要欄里只報告那些已經過質譜分析的點，這樣 PROTICdb 通過自動知識庫分析工具更新蛋白點的注釋。
( 23 ) 把鼠標移到 DV02121001 凝膠上的 1757 號紅點上。鑒定結果以藍色文本文件輸出，意味著這個注釋是從另一個相關點的信息中推導出來的。在鑒定結論的上方顯示這個特定的關系。
( 24 ) 左鍵點擊 DV02121001 凝膠上的 1757 號紅色點。顯示點的信息內框。
( 25 ) 完善關系和鑒定目錄，關系隨著建議的鑒定信息一起報告。出現一個如何得到這個鑒定的警示信息。
( 26 ) 與 DV02041611 凝膠上的 1647 號點進行比對。
3. 量化數據輸出
點的量化數據 （面積、峰高或體積）可以列表文件格式輸出，而且很容易導入到任何電子制表軟件或統計包中。
( 1 ) 訪問 PROTICdb 主頁，并登錄網頁。
( 2 ) 開啟凝膠瀏覽器，主菜單—凝膠瀏覽（見注釋 16)。
( 3 ) 從菜單工具欄中，選擇 Tools→Projects data export 或同時按 Ctrl d 。 跳出數據輸出框（在數據輸出之前沒必要加載任何凝膠圖像)。
( 4 ) 選擇你要輸出數據的項目。
( 5 ) 選擇編號系統（見注釋 17)。在一個既定的編號系統內比較那些共享相同號碼的蛋白點才有意義。選定了編號系統，就會顯示一張數據集表格。每張凝膠的蛋白點的檢測方法名稱和量化方法名稱都會被標示出來。用戶可以導出用相同方法處理的數據。
( 6 ) 通過復選相應的內容框，選擇將要被導出的數據，然后點擊 OK。
( 7 ) 選擇面積、體積或峰高。你也可以選擇一個缺失數據的代碼。點擊 OK。
( 8 ) 選擇結果導出方法：表格、剪貼板或文件。行顯示點，列顯示膠（條件）。