美國東部時間2022年10月21日,第二屆美國華人質譜學會(CASMS)學術研討會暨展覽會在Gather Town迎來最后一天的日程。本屆會議以“Advancing Biological and Pharmaceutical Mass Spectrometry”(推動質譜在生物與藥物領域的技術應用發展)為主題,共邀請超過60位來自美國、加拿大、中國、荷蘭以及新加坡等國家的科研學界以及工業界的杰出研究人員帶來精彩演講。分析測試百科網作為會議支持媒體全程為您報導。
本次大會閉幕報告將話筒遞交給美國默沙東科學助理副總裁Kevin Bateman博士。他報告的題目為“Mass Spectrometry in Industry: Innovation and Opportunity”。 Kevin Bateman介紹到,隨著質譜技術的發展,科研對質譜的依賴性逐漸增加,世界市場對質譜的需求也逐漸上升。
質譜技術現階段已經可以解決很多10年前無法想象的問題。但現階段質譜仍面臨著新的挑戰。Kevin Bateman表示,現階段質譜的靈敏度、碎片化、改進藥物代謝鑒定、通量和自動化等方面已經難以滿足日益增長的科研需求。Kevin Bateman介紹了他現在的項目:建立AE-MS實驗,建立了一個模型,根據可利用化合物的反應預測化學實體在選定基質中的大體積化學空間響應;并通過預測的響應與置信區間來近似化學實體濃度。簡單來說說就是通過已知的數據構建的大數據集,預測尚未實行實驗中出現的問題,并預先改進實驗方法使實驗得以自動化。
針對以后基于大數據的自動化是否會替代人工,Kevin Bateman持積極態度。他認為,機械自動化的實驗毫無疑問會代替一些人工工作,但是這些往往是重復性的工作。如果可以實現實驗研究工業化,科研工作者將會從大量基礎性的研究工作中解放出來,進而把精力投入在更為尖端、更具開創性的工作上。
隨后,CASMS大會主席Lan Huang宣布了本屆大會“Poster Award Winners”名單,蛋白質組學組包括中國西湖大學Li Lu、密歇根大學Fengchao Yu、喬治華盛頓大學Ashley Frankenfield等7人;小分子組包括弗羅里達大學Julia Bonney、清華大學 Hengxue Shi、俄拉克荷馬州大學 Zongkai Peng等7人。獲得“Committee on CASMS Poster Awards”有Yue Chen、Ling Hao、Lingjun Li等9人獲得。獲得“Lightning Talk Award”有新澤西理工大學Yongling Ai、威斯康星大學麥迪孫分校Elizabeth Bayne、南京醫科大學Yun Chen等8人。最后大會主席Lan Huang感謝所有所有參會人員在過去5天內的參與和付出,并希望能在下次大會與大家再次相遇。
Poster Award Winners獲獎名單
Committee on CASMS Poster Awards獲獎名單
Lightning Talk Award獲獎名單
報告題目:LC-MS/MS-based metabolomics in identification of novel therapeutic targets and risk factors of gut diseases
報告人:新加坡國立大學Guodong Zhang副教授
Guodong Zhang團隊主要研究如何降低結腸炎和結腸癌的風險。在研究中,Zhang借助LC-MS/MS分析工作流程發現CYP環氧酶十二烷基途徑在結腸癌中其關鍵作用,這一發現表明植物油的主要成分—亞油酸是誘發結腸癌的危險因素。另外,團隊也發現sEH是誘發肥胖疾病的新靶點。
報告題目:Applying JUMP software pipeline to decode TMT-LC/LC-MS/MS based whole proteome and phosphoproteome
報告人:美國田納西州圣猶達兒童研究醫院高級生物信息學研究科學家 Zuo-fei Yuan
Zuo-fei Yuan介紹了使用的JUMP軟件,該軟件可以定量分析全蛋白組和磷酸化蛋白質、繪制全蛋白組表達譜、磷酸化蛋白質組的表達譜和激酶分析,并且可完成全蛋白組和磷酸化蛋白質批量定量分析。
報告題目:Web-based tools for comprehensive multi-omics analysis
報告人:麥吉爾大學Jessica Ewald
多組學與單一組學相比可以獲得更多的數據,有助于提供正交信息或減少因冗余信息造成的少報、誤報。Jessica Ewald報告了通過基于網絡工具構建了多組學集成網絡,其可以應對多組學復雜的結果,并將結果可視化幫助后期分析解釋。
報告題目:Multi-omics analysis of colon mucosa and wall from patients with Crohn’s Disease
報告人:AbbVie生物研究中心高級科學家 Liang Jin
炎癥性腸病(IBD)是一種消化道組織慢性炎癥的疾病,包括克羅恩病(CD)和潰瘍性結腸炎(UC)。Liang Jin團隊采用不同的多組學整合方法分析分離的CD患者結腸粘膜和腸壁的轉錄組學和蛋白組學數據,利用蛋白質基因組學可以揭示得到更具體的獨特信息。
報告題目:A new perspective for aging research: the proteome that decorates reactivated heterochromatin
報告人:美國紐約阿爾伯特愛因斯坦醫學院 Simone Sidoli副教授
Simone Sidoli關注以多組學的方法研究衰老和致病的機制,尋找影響衰老或引起異常的分子標志物,將有助改善人類健康,將人類壽命在延長到一個新的高度。Simone Sidoli團隊開發了一個模型,調查重新激活的異染色體、假轉錄和蛋白質組的解碼染色質結構,并確認了EXOSC 4是維持異常解碼染色質保持低轉錄水平的關鍵因素。
報告題目:The unknown and unidentified gaps in biochemical networks, or the triangle affairs between genome, metabolome and exposome
報告人:美國康涅狄格州法明頓杰克遜實驗室 Shuzhao Li副教授
代謝模型可以預測多組學整合信息。Shuzhao Li團隊構建了代謝組學的概率代謝物和網絡模型,解決了代謝組學信息組裝的問題。
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