2010年10月18~19日，由國家自然科學基金委、中國化學會分析化學委員會主辦，復旦大學、上海交通大學承辦的2010年微納尺度分離和分析技術學術會議暨第六屆全國微全分析學術會議在上海復旦大學復宣大酒店隆重召開。來自全國高等院校、科研機構、企事業單位的300余名專家學者出席了本次會議。AB SCIEX公司作為本屆大會的金牌贊助商，成功參展此次大會。會議期間，來自AB SCIEX公司亞太應用支持中心的靳文海博士為大家詳細介紹了AB SCIEX生物質譜技術。
AB SCIEX公司亞太應用支持中心 靳文海博士
靳博士首先指出AB SCIEX公司是生產高端質譜系統的專業廠家，在全球質譜市場占有率與用戶滿意度排行榜上高居榜首。AB SCIEX液相色譜串聯質譜系統在食品安全等應用市場發揮著重要的作用，幫助解決了我國多個重大食品安全事件的技術問題及爭端，如三聚氰胺事件中快速反應并提供檢測方法、云南商檢局出口菌菇尼古丁超標爭議、青島商檢局出口肉類產品瘦肉精超標爭議等。
AB SCIEX公司始終關注于蛋白質組學的研究，無論在生物標志物的發現以及蛋白質定量方面，AB SCIEX公司均都提供了各種各樣的質譜平臺，其中包括MALDI-TOF/TOF質譜、QTRAP質譜以及Triple TOF? 5600質譜系統。接下來，靳博士分別對上述這三大質譜平臺的產品特點及技術優勢進行了詳細的介紹。
MALDI TOF/TOF質譜系統
5800 MALDI-TOF/TOF質譜系統
AB SCIEX公司推出的4800和5800這兩款MALDI-TOF/TOF質譜系統，具備靈敏度高、分析速度快、分辨率高、分析復雜樣品能力強等優勢。AB SCIEX MALDI-TOF/TOF質譜可謂是真正硬件上的串聯飛行時間質譜，配備高效CID，能量可調，從而具備了更為強大的MSMS分析能力。
5800 MALDI-TOF/TOF質譜還具備自動加熱清洗源功能，可最大程度的避免離子源收到污染。由于5800 MALDI-TOF/TOF不論是在硬件還是軟件上都有了大幅度的改進，使得該系統的一級質譜和二級質譜在質量穩定性、質量精確度以及分辨率方面都有了很大程度的提升。
靳博士尤其指出糖類化合物的分析非常復雜，由于5800 MALDI-TOF/TOF質譜系統的CID碰撞室在兩級TOF之間，因此具備更多的斷裂模式，可根據通過調節CID的碰撞能量，從而獲得更為精確的分析結果。
QTRAP質譜系統
5500 QTRAP四極桿-線性阱雜交質譜儀
使用MRM進行生物標志物的驗證以及目標蛋白質的定量是近幾年在業界剛剛興起的研究方向，從2008年起期刊上發表的論文數量也越來越多，使得分析人員意識到使用MRM進行蛋白質定量的重要性。
AB SCIEX公司始終推薦給用戶采用Qtrap質譜系統進行生物標志物的驗證研究。AB SCIEX公司用于蛋白質組學分析的Qtrap質譜系統包括3200 QTRAP、4000 QTRAP和5500 QTRAP這三款產品。
QTRAP質譜系統最大的技術特點是具備的MIDAS工作流程，該技術結合了Qtrap質譜儀串聯四極桿的高選擇性的MRM掃描和線性離子阱高靈敏度的MS/MS掃描功能。軟件能夠自動構成MRM離子對，MRM采集后，便迅速在離子阱內進行MS/MS全掃描。由于QTRAP質譜系統的第三個四極桿能夠在1ms的情況下切換成線性離子阱，使得MS/MS掃描靈敏度提高500倍左右，有效去除假陽性。
采用MRM進行蛋白質定量的另一個重要的環節就是需要有內標，因此AB公司推出了一款mTRAQ?試劑，它是一種定量的內標，實現歸一化，提高定量實驗的重復性和一致性。其特點為：
靳博士在這里還指出蘇黎世理工學院（ETH）借助AB SCIEX的QTRAP技術研發成功全球首個蛋白質組學MRM Atlas數據庫，MRMAtlas是一個能夠實現數據共享的在線數據庫。全球的科學家都可以使用atlas數據庫，來顯著提高生物標記物研究、基于蛋白的藥物發現和基礎生物及生物醫學研究的效率。MRM Atlas提供了簡單、認證的方法，可以將蛋白質組學研究拓展到前所未有的領域。
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Triple TOF? 5600質譜系統
Triple TOF? 5600質譜系統
最后，靳博士向大家隆重介紹了AB SCIEX公司在今年ASMS推出的Triple TOF? 5600質譜系統。該儀器首次在一個平臺上，同時具有三重四極桿典型的定量能力和高分辨、精確質量測定的定性能力。
Triple TOF? 5600系統的主要特點為：
（1）高靈敏度。在全掃描和二級質譜掃描方式，靈敏度達到業界高端QQQ質譜的MRM水平，使得更多低豐度的蛋白質能被檢測和鑒定到；
（2）SmartSpeed? 100Hz采集速率
（3）高分辨率，在任意掃描速度下質譜分辨率都可達到40000；在低質量端m/z 100左右，也可達到30,000以上的分辨率
（4）EasyMass? 質量準確度，質量準確度小于1ppm（RMS），MS和MS/MS都能達到，從而提供最可信的蛋白質鑒定數據
（5）線性動態范圍，可達5個數量級
（6）系統非常可靠，用外標法，質量誤差長期可以保持在~1ppm。
這一全新的TripleTOF 5600 高分辨液相色譜質譜聯用系統能夠對復雜的蛋白質組學樣品進行高通量分析，并能同時完成未知物篩查（Explore）、多目標物同時定量/定性（Profile）以及定量分析（Quantify）這三個工作流程。靳博士在這里例舉了采用納升液相色譜和TripleTOF 5600 聯用系統的一系列實驗。
在蛋白質和肽段鑒定方面，靳博士例舉了對酵母細胞裂解物的胰酶消化產物的分析實驗。在60min梯度，2000ng上樣量的前提下，該實驗采用了每秒最多采50幅串聯質譜譜圖的信息相關采集模式，單次LC-MS/MS 實驗就鑒定了10,179 條獨特肽段和1174 種蛋白。通過ProteinPilot Software 4.0數據庫檢索，結果表明所有肽段的RMS平均偏差為1.7ppm，其中包括大量的低豐度肽段。
此外，為了檢驗TripleTOF 5600 的定量能力，對一組含有五種已知蛋白以及部分重同位素標記肽段的樣品進行分析。實驗中這五種蛋白質都獲得了很高的序列覆蓋率，其中進樣量僅有100amol 的Peroxiredoxin 1 蛋白的序列覆蓋率也高達53%。而測試中得到肽段的平均質量偏差僅為1.7 ppm，展示了TripleTOF 5600 的高質量準確度和穩定性。同時還獲得了高度準確的定量結果，充分證明了TripleTOF 5600 能夠提供三重四極桿系統級別的定量結果。
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