摘要 : 2014年10月13日,中國北京 -生命科學分析儀器技術發展的全球領導者AB SCIEX和Illumina(納斯達克:ILMN)今天聯合宣布雙方將針對OneOmics?項目開展獨家合作,將基于SWATH?的新一代蛋白質組學(NGP)和新一代測序(NGS)工具在云計算環境中結合使用。
2014年10月13日,中國北京 -生命科學分析儀器技術發展的全球領導者AB SCIEX和Illumina(納斯達克:ILMN)今天聯合宣布雙方將針對OneOmics?項目開展獨家合作,將基于SWATH?的新一代蛋白質組學(NGP)和新一代測序(NGS)工具在云計算環境中結合使用。
AB SCIEX的SWATH?蛋白質組學云工具套件應用將托管于BaseSpace中。這是Illumina專為推動基因組學分析而設立的應用庫和基于云的信息學社區。通過本次合作,BaseSpace將成為基因組學和蛋白質組學“大數據”的唯一存儲地點。利用快速安全而流暢的復雜多組學數據集分析,該解決方案將有助于推動生物標志發現,協助癌癥、糖尿病、老年癡呆癥和心臟病等疾病的研究。
系統生物學研究所所長Leroy Hood表示:“以AB SCIEX和Illumina雙方的精彩合作為契機,開展基因組學和蛋白質組學數據綜合分析,必將進一步推廣計算分析的應用面,實現數據分析的普及和標準化,并為生命科學的系統生物學領域提供一個平臺。”
采用AB SCIEX SWATH?蛋白質組學軟件,用戶可在使用傳統“鳥槍法”蛋白質組學測量難以重現的不完整蛋白質集時,解決“丟失數據問題”。SWATH?率先實現了針對多種樣本的可重復蛋白質組研究,并通過結合Illumina的NGS技術將進一步得到強化。
AB SCIEX總裁Rainer Blair表示:“SWATH?軟件是一種創新型技術,基本無需研制新方法就能夠一次性檢驗數千個蛋白質。在與云應用結合后,我們的客戶處理數據的速度現可加快50倍。OneOmics項目將幫助組學研究取得更加理想的成效。我們已經開發出四款SWATH應用,可支持蛋白質組學質譜分析數據的處理、分析和可視化,以挖掘生物奧秘。”
隨著NGP和NGS產生數量不斷增加的數據,雙方通過密切合作幫助安全地存儲、提取和管理大規模復雜數據集并在生物環境中對其進行可視化,進而突破生物醫學研究的瓶頸。蘇黎世瑞士聯邦理工學院(ETH)分子生物學研究所的Ruedi Aebersold博士兼教授表示:“借助該平臺,研究人員能夠更迅速高效地建立可預測、可測試且行之有效的疾病模型。本質上,它把生物系統多層次分析的重點從實驗室現場數據采集轉移到計算領域,在這里可從全球范圍共享大數據集。”
AB SCIEX SWATH?云工具套件帶來了越來越多的BaseSpace應用,能夠從SWATH?蛋白質組學質譜分析數據挖掘出生物奧秘,具體包括:
Protein Expression Extractor – 用于處理原始質譜分析數據
Protein Expression Assembler – 用于蛋白質倍數變化分析
Protein Expression Browser –用于在生物環境中對結果進行可視化
Protein Expression Analytics –用于數據質量審核
Illumina公司發展高級副總裁兼企業信息學總經理Nicholas Naclerio指出:“這些新蛋白質組學工具將系統生物學功能帶給BaseSpace,創建了一個基于云的易用型環境,有助于針對越來越多的應用快速完成數據分析。現在,任何需要真正的跨學科系統級生物學信息的人都可以從BaseSpace中找到所需信息。”
BaseSpace應用提供的信息學解決方案能夠幫助客戶充分利用日益龐大的術、商業和開源提供商群體提供的工具。BaseSpace中現已提供AB SCIEX SWATH?蛋白質組學云工具套件,敬請訪問:www.basespace.com。
關于AB SCIEX
AB SCIEX可幫助科學家和實驗室分析人員充分應對他們所面臨的復雜分析挑戰,并改善我們的世界。公司在液相色譜分析—質譜分析行業占據全球領先地位,能夠提供世界一流的服務與支持,是世界各地從事基礎研究、藥物研發、食品安全與環境檢測、司法鑒定與臨床研究的數千名科學家和實驗室分析人員值得信賴的合作伙伴。AB SCIEX擁有超過25年的業經驗證的創新技術,在其領域遙遙領先,通過傾聽并理解客戶不斷發展變化的需求,開發可靠、靈敏而直觀的解決方案,讓常規分析和復雜分析的結果不斷深化。更多資訊,請您登陸AB SCIEX 公司網站:www.absciex.com。
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AB SCIEX儀器僅用于研究目的,不可用于診斷流程。
本文提及的商標根據具體情況,均為AB Sciex Pte. Ltd.、Illumina, Inc.或其各自所有者的財產。AB SCIEX?經許可后方能使用。。? 2014年AB SCIEX公司版權所有。保留所有權利。
關于Illumina
作為全球測序和陣列技術領先廠商,Illumina正在不斷改善人類健康。公司為來自眾多市場的客戶提供服務,實現基因組學解決方案在研究領域和臨床領域的普遍應用。如欲了解Illumina如何釋放基因組學的威力,敬請訪問www.illumina.com并了解@illumina的最新動態。
Illumina前瞻性聲明
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