ASMS新品速遞|timsTOFUltra2引領極微量樣本蛋白組學革命

　　· timsTOF Ultra 2在對哺乳動物細胞、癌細胞系或組織活檢的4D-蛋白質組學分析中鑒定深度和置信度大大提高；

　　· timsTOF Ultra 2憑借其極致的靈敏度僅需25pg的蛋白樣本量，便能檢測出超過1000種蛋白質，為外周血單核細胞（PBMCs）、小型免疫細胞、細菌細胞或亞細胞器蛋白質組學和疾病生物學研究打開了新視角；

　　· timsTOF Ultra 2在25pg的酶解樣品中鑒定和定量的蛋白數量增加50%，多肽數量增加高達100%（FDR卡值為1%）；

　　· tims TOF Ultra 2對于樣本量較低的4D-蛋白質組學應用方向，能夠提升約40%的多肽和20%的蛋白質鑒定；

　　· 先進的離子電荷控制（ICC 2.0）技術使得timsTOF Ultra 2適用于從超微量皮克到微克級別的寬上樣量范圍；

　　· 布魯克還推出了全新的top-down蛋白分析軟件OmniScape^TM，能夠從MALDI-ISD和LC-TIMS-MS/MS數據中自動、近乎完整地覆蓋蛋白質序列；

　　· Biognosys推出了具有優化的AI功能Spectronaut^? 19 （SN19），進一步提升蛋白質定量的深度和更高的肽段序列覆蓋度；

　　· SN19目前針對timsTOF MS/MS數據進行了訓練，能顯著提高4D-蛋白質組學的分析性能；

　　· PreOmics推出了高重復性且經濟的深度血漿4D-蛋白質組學ENRICHplus試劑盒，可在timsTOF HT質譜上實現7倍的血漿蛋白鑒定深度提升；

　　· 全新4D-糖蛋白分析功能：glyco-PASEF^?采集模式和 GlycoScape^TM分析軟件；

　　· 布魯克現已向客戶發貨超過1000套timsTOF系統；

　　· 布魯克在2024年美國質譜學會年會（ASMS）上推出三款質譜儀，用于4D-蛋白質組學、多組學組織成像以及高置信度應用分析。

　　美國加利福尼亞州阿納海姆——2024年6月3日，在第72屆ASMS會議上，布魯克公司（納斯達克代碼：BRKR）推出了全新的超高靈敏度timsTOF Ultra 2質譜儀，該系統大大提高了對微小細胞、亞細胞細胞器進行深度分析的靈敏度，并增加了樣本進樣量范圍的靈活性。結合新的Spectronaut^?  19軟件和全新的PreOmics ENRICHplus試劑盒，布魯克正在建立從超高靈敏度到大規模深度血漿蛋白質組學的4D-蛋白質組學新標準。此外，布魯克還推出了OmniScape^TM軟件，用于完整蛋白的自上而下的序列確認和從頭測序分析。

　　布魯克全新timsTOF Ultra 2重新定義靈敏度

　　全新timsTOF Ultra 2擁有超高的靈敏度，僅需要25pg的蛋白消化液，即相當于HeLa細胞蛋白量的1/10，鑒定和定量的蛋白數量增加50%，多肽數量增加高達100%。這使得timsTOF Ultra 2成為分析小型外周血單核細胞（PBMCs）低豐度蛋白質的最佳選擇，或用于微生物群落中的細菌細胞，以及從生物活檢樣本中發現癌癥新抗原的免疫肽組學研究。

　　新的離子電荷控制（ICC2.0）軟件提供了從皮克到微克級別的樣本進樣量靈活性。

　　布魯克 ProteoScape? 軟件集成了Biognosys的Spectronaut 19（SN19）軟件，該軟件是DIA數據分析的金標準。全新的SN19改進了搜索引擎的AI功能和定量能力，并能夠精確預測分析物的碰撞截面積（DeepCCS）、保留時間（DeepiRT）和碎片離子強度（DeepFrag），從而平均增加13%的蛋白質鑒定和提升定量準確性。請參閱Biognosys新聞稿

　　PreOmics推出高可重現性、經濟的ENRICHplus試劑盒結合久經驗證的穩定質譜平臺timsTOF HT，建立深度血漿4D-蛋白質組學解決方案

　　全新的單磁珠PreOmics ENRICHplus試劑盒結合timsTOF HT，可使血漿蛋白質組獲得比純血高出7倍的蛋白鑒定和定量能力。隨著覆蓋深度的增加，加上timsTOF HT久經考驗的高通量和穩定性，使得大規模的深度血漿蛋白質組學成為可能。請參閱PreOmics新聞稿

　　英國牛津大學蛋白質組學設施發現部門負責人、副教授Roman Fischer博士表示：“timsTOF技術與ENRICHplus正在改變我們進行血漿蛋白質組學研究的方式。在timsTOF Pro上，我們僅需使用 20 μL 的血漿，就能以每天60 個樣品的通量，實現平均每個樣品 3800 個蛋白質的鑒定。我們以前從未在一次分析中達到過這樣的深度，現在我們可以檢測組織滲漏蛋白質和其它低豐度的癌癥和神經退行性疾病潛在生物標志物。與強大的timsTOF系統結合，ENRICHplus正在為大規模深度、經濟實惠的血漿蛋白質組學帶來變革。”

　　布魯克推出OmniScape?自上而下的完整蛋白分析軟件

　　布魯克推出了OmniScape?，這是第一款自上而下的蛋白質序列分析軟件，涵蓋了蛋白質從頭測序和通過同源性搜索進行詳細蛋白質變體的分析。

　　威斯康星大學麥迪遜分校的Boris Krichel博士總結道：“我對在非靶向自上而下蛋白質組學中通過從頭序列分析來發現和注釋蛋白質感到興奮。OmniScape?最令人印象深刻的功能是其基于不同的動態修飾類型自動匹配給出蛋白質變體結果。”

　　OmniScape?支持來自LC-CCS-MS/MS的不同數據類型，例如可用于分析多種磷酸化蛋白質。它整合不同數據集的結果得到非常高的序列覆蓋，提供可靠的序列確證和PTMs（翻譯后修飾）鑒定與區分。OmniScape?可以處理timsTOF fleX和MALDI-TOF質譜儀（包括新款的neofleX）MALDI-ISD自上而下的譜圖，以及來自非布魯克儀器的數據，作為一種全面的自上而下的蛋白質序列分析和異構體解析的解決方案。

　　丹麥Novonesis高級科學經理Christian Isak J?rgensen博士補充道：“OmniScape滿足了生物技術行業生產重組蛋白質的真正需求。”

　　4D-糖蛋白組學的新型采集模式和計算分析能力

　　布魯克推出了第一款實時糖蛋白組學分析軟件——GlycoScape?。GlycoScape?是與拉德堡德大學醫學中心Hans Wessels博士領導的EnFORCE公-私合作項目合作開發 ^[1]，可以在采集數據時快速識別糖肽，無需依賴糖鏈庫，不僅可以識別以前未報告的糖鏈，還可以大大減少假陰性結果。GlycoScape?對糖蛋白質組數據的無偏向性識別對于糖生物學在轉化和臨床研究中的進展至關重要，因為這些重要的研究領域在后基因組時代變得觸手可及。

　　荷蘭拉德堡德大學高級研究員Hans Wessels博士強調了其關鍵優勢：“GlycoScape? 為timsTOF平臺的糖蛋白質組質譜數據的實時處理打開了大門，不再受限于糖鏈數據庫的限制。”

　　GlycoScape結合布魯克與烏得勒支大學Albert Heck教授團隊合作開發的具有選定目標離子區域功能的新型glyco-PASEF采集方法，使用階梯能量碎裂前體離子，可以快速獲得超高靈敏度糖蛋白質譜數據。

　　烏得勒支大學化學和藥物科學教授、荷蘭蛋白質組學中心科學主任Albert Heck博士指出：“我們很高興能夠利用timsTOF平臺的獨特優勢在糖蛋白組學領域取得開創性成果，現在我們已經將這一技術轉化為glyco-PASEF方法進行糖生物學研究。”

　　[1] 該合作項目由Health~Holland頂級生命科學與健康部門授予的PPP（公私合作伙伴關系）津貼共同資助，旨在促進公私合作伙伴關系（資助編號：LSHM21032）。

　　關于布魯克公司——后基因組時代的新興領導者

　　布魯克（納斯達克：BRKR）致力于幫助科學家在后基因組領域取得突破性發現，并開發新的應用，從而提高人類的生活質量。布魯克的高性能科學儀器和高價值分析和診斷解決方案使科學家能夠在分子、細胞和微觀層面探索生命和材料。通過與客戶的密切合作，布魯克在后基因組生命科學分子和細胞生物學研究、應用和制藥應用、顯微鏡和納米分析以及工業應用方面實現了創新，提高了生產力，幫助客戶取得成功。布魯克在臨床成像、臨床表型組學研究、蛋白質組學和多組學、空間和單細胞生物學、功能結構和凝聚態生物學，以及臨床微生物學和分子診斷領域提供差異化的高價值生命科學和診斷系統和解決方案。欲了解更多信息，請訪問www.bruker.com。