一、實罐滅菌
1、將冷凝水管路斷開，拔下電極，打開罐蓋，將培養基裝入發酵罐及補料瓶，易產生泡沫的培養基盡量不要超過兩升。
2、連接管路：
取樣管路連接，補料管路連接；
空氣過濾器用硅膠管與罐蓋空氣管連接，并用彈簧夾夾緊；
排氣口與過濾器用硅膠管連接；
安裝溫度電極、pH電極、溶氧電極，pH電極用們帽蓋緊電極上端口，溶氧電極用鋁鉑紙包裹電極上端口，防止受潮。
蓋緊其它罐蓋接口。
3、提起玻璃罐體及補料瓶放入滅菌鍋，蓋好牛皮紙，蓋好鍋蓋，確定發酵溫度及時間。
4、滅菌結束后，盡快將罐放回原位并盡快通入空氣。
二、發酵操作
1、將滅菌后的罐體放回原位，連接冷凝水管路，通入冷凝水，連接通氣管路，調整通氣量至3～5L/min。
2、將溫度電極、pH電極、溶氧電極與控制器連接。
3、補料管連接：
打開補料蠕動泵防護蓋，搬開進出口處的白色管夾，將硅膠管嵌入入口處的管夾并夾緊，用手轉動泵頭，將硅膠管沿凹槽安裝直至出口處，開手動開關約十秒后夾緊出口處管夾，關手動開關；
將酒精棉球放在罐蓋補料口內，將針頭插入并穿透密封蓋；
打開蠕動泵手動開關，使輸液管中充滿料液，置于自動狀態。
4、酸堿液、消泡劑操作同補料操作。
5、接種：旋松接種口，在火焰保護下，打開接種口，倒入種子，旋緊接種蓋，移去火焰圈。
6、開始發酵：
（1）打開控制器電源，按Alt＋F1鍵，輸入密碼，進入過程參數畫面，設定發酵過程參數：
溫度設定：
按F1進入溫度設定，按F1輸入設定溫度并確認；
按F2選擇控制方式，一般設定為自動，即恒溫發酵，如選擇順控需設定順控操作；
按F3輸入手動輸出百分比，最大為+100%，最小為-100%；
按F4輸入輸出極限；
按F5輸入報警極限的上限與下限。
pH值設定：
pH值F1～F5設定同溫度設定；
按F6選擇是否聯動，聯動補料開時，補料1的控制權交給了pH參數，補料控制方式自動切換到手動狀態，補料的控制周期同期為pH的控制周期；
轉速設定：
手動輸出為0～100%，其它與溫度設定相同。
溶氧設定：
按F3進入串級設定，默認為轉速，溶氧與轉速串級時，原轉速為手動狀態時自動轉換到自動跟蹤狀態，轉速設定值不超出根據溶氧需要提供的極限設定范圍，轉速控制權交給溶氧；與空氣串級時，情況相同；
其它設定同溫度設定。
空氣參數、壓力參數設定同溫度設定。
（2）按ESC鍵進入主菜單，按F2進入初始化菜單，按F1設定發酵批號并確認，再按F2發酵開始并確認。（不設發酵批號系統將不保存過程數據）
三、取樣操作
先松開彈簧夾J2（發酵罐平衡口－取樣罐平衡口），將取樣管內殘液混入發酵罐內，再夾緊J2，將出料管放入接料瓶，松開J3（取樣管夾），發酵液被壓入接料瓶，可減少排氣加快取樣速度，開J2、J3排出取樣管內殘料后放開J3、J2夾緊。